Immunoloogiline sünaps, mida nimetatakse ka immuunsünapsiks, on ruum antigeeni ja antikeha vahel, mis eksisteerib siis, kui need kaks molekuli on seotud. Antikeha suudab selle sünapsi kaudu toimetada antigeenile kemikaale. Neid kemikaale kasutatakse keemiliste reaktsioonide ahela käivitamiseks, mille tulemuseks on antigeeni hävitamine.
Immunoloogilises sünapsis osalevad kahte tüüpi makromolekulid või suured molekulid. Üks neist on antikeha, mis on teatud tüüpi immuunrakud, mida nimetatakse lümfotsüütideks ja mida toodetakse loomade, sealhulgas inimeste kehas. Teist molekuli tuntakse antigeenina. Antigeene peetakse elusorganismides vaenulikeks ja need võivad olla mitmesugused asjad, sealhulgas valgud, bakterid ja viirused ning kahjutud molekulid, nagu õietolm või muud allergeenid. Antikehad tõmmatakse antigeenide poole, et need hävitada ja vältida haigusi või nakkusi organismis.
Antigeeni organismist eemaldamise protsess nõuab mitmeid etappe. Esiteks tõmbab antikeha antigeeni külge. Kui need kaks seonduvad, vabastab antikeha kemikaale, mis liiguvad läbi immunoloogilise sünapsi, kuni jõuavad antigeenini. Need molekulid seonduvad antigeeni pinnaga, käivitavad keemiliste reaktsioonide ahela ja lõpuks hävitavad võõrkeha. Kui lümfotsüüt vabastab kemikaali antigeeni pinnale, liigub see antigeenist eemale, kõrvaldades immunoloogilise sünapsi.
Antigeenide ja antikehade vahelised sünapsid on sarnased närvirakkude omadega. Kaasatud ruumid on väga väikesed, sageli alla 1 mikroni (0.0001 cm). Antigeen ja antikeha ei puutu kunagi kokku, kui antikeha saadab kemikaale läbi immunoloogilise sünapsi. Pärast antigeeniga seondumist vabastab antikeha võimsaid toksiine, mida nimetatakse tsütokiinideks. Tihe seondumine antigeeniga takistab tsütokiinide levikut teistesse kehaosadesse, kus need võivad teisi rakke kahjustada.
Iga antikeha saab korraga seonduda ainult ühe antigeeniga. Samas võib samale antigeenile kinnituda mitu antikeha. Antigeeni, mille külge on kinnitatud mitu antikeha, saab kiiremini neutraliseerida.
Immunoloogilise sünapsi esialgsed uuringud viisid lõpule mitmed erinevad teadlased. Abraham Kupfer avastas sünapsi. Nähes, et kahe makromolekuli vaheline ruum toimis sarnaselt närvirakkude vahelise sünapsiga, nimetas Michael Dustin immunoloogilise sünapsi. Avastusest teatati 1995. aastal.