Hüpoteeklaenu puudujääk tekib siis, kui kodu müüakse või võetakse tagasi hüpoteegiga võlgnetavast summast. Kui näiteks kodu väärtus alates selle ostmisest oluliselt langeb, võib majaomanik olla sunnitud selle müüma palju odavamalt, kui on hüpoteegil. Erinevus kodu müügi eest saadava ja veel võlgnetava vahel on hüpoteegi puudujääk. Isikud, kes sõlmivad oma hüpoteegi esmakordsel saamise korral kindlustushüvitise, saavad need puudujäävad vahendid kindlustusseltsilt pangale tagasi maksta; aga enamasti pöördub kindlustusselts ümber ja tuleb nende vahendite järele uuesti majaomanikule järele.
Hüpoteeki hoidvale pangale ei ole tegelikult vahet, kas maja saab tagasi või müüb majaomanik kodu iseseisvalt; nad tahavad lihtsalt sisse nõuda selle, mis on hüpoteegi pealt võlgu. Kui majaomanik seda ei maksa, on pank tavaliselt motiveeritud võtma laenuvõtja vastu õiguslikke meetmeid, kuni nad raha tagasi saavad. Mõnel juhul võib hüpoteegi puudujäägile lisada ka kodu müügiga seotud kulud, nagu hindamistasud, kinnisvara tasud ja sulgemiskulud, mis suurendab võlga veelgi.
Nagu eespool mainitud, saab hüvitiskindlustust kasutada laenuandjale hüpoteegi puudujäägi vahe väljamaksmiseks. Kindlustusselts aga nõuab neid rahalisi vahendeid, seega on peaaegu alati vaja need välja maksta. Mõned inimesed on sunnitud pankroti välja kuulutama, kui nad ei suuda tasuda hüpoteeklaenu puudujäägi vahet. Teised proovivad teisi võimalusi, näiteks püüavad arveldada pangaga lõppmakse eest, isegi kui see ei ole kogu võlgnetav summa. Eksperdid soovitavad seda tüüpi leping alati kirjalikult vormistada, et pank ei saaks pärast arveldamist jätkata makse nõudmist.
Kui majaomanik on sunnitud hüpoteeklaenupuudujäägiga kodu maha müüma, jääb see tema krediidiaruandesse. See võib muuta kodu ostmise või muud tüüpi laenu saamise keerulisemaks, alates isiklikust laenust kuni auto laenuni. Üldjuhul soovitatakse majaomanikel võtta kõik võimalikud sammud, et vältida hüpoteeklaenu puudujääki, ning kui kodu ei ole võimalik hüpoteegi väärtuses maha müüa, astuda samme võla võimalikult kiireks lahendamiseks, et minimeerida negatiivset mõju krediidile.