Hüpofüüsi vars on väike, lehtrikujuline halli aine osa, mis ühendab hüpofüüsi hüpotalamusega. Hüpotalamus kasutab seda hormoonide saatmiseks hüpofüüsi. Hüpofüüs ei tooda hormoone, välja arvatud juhul, kui hüpotalamus seda juhendab.
Hüpotalamus on hüpofüüsi varre abil ühendatud hüpofüüsiga. Hüpofüüsi vars on ainult umbes 0.1 tolli (3 mm) lai, kus see ühendub hüpotalamuse põhjaga, ja 0.08 tolli (umbes 2 mm) lai, kus see ühendub hüpofüüsi ülaosas. See on ühendatud hüpofüüsiga tagumises piirkonnas.
Hüpofüüsi varre ülesanne on viia hüpotalamuses loodud hormoonid hüpofüüsi alla. Hormoone, sealhulgas dopamiini, toodavad hüpotalamuse spetsiaalsed rakud. Kui need on sünteesitud, liiguvad hormoonid mööda hüpofüüsi varre alla ja vabanevad hüpofüüsis. Seejärel järgib hüpofüüs hormoonides kodeeritud juhiseid.
Mõned hüpotalamusest pärinevad hormoonid juhendavad hüpofüüsi tootma teisi hormoone, mis seejärel vereringesse vabanevad. Türeotropiini, kasvuhormooni, kortikotropiini ja gonadotropiini toodab hüpofüüs, kuid neid hormoone ei teki enne, kui nääre saab juhised nende sünteesimiseks ja hüpotalamusest vereringesse vabastamiseks. Need juhised tulevad hormoonide kujul, mille hüpotalamus saadab hüpofüüsi varre alla.
Mõned levinumad hormoonid, mis liiguvad mööda hüpofüüsi varre alla, on dopamiin ja gonadotropiini vabastav hormoon. Dopamiini kasutab keha emotsioonide reguleerimiseks ja see on hea vaimse ja füüsilise tervise säilitamiseks ülioluline. Hüpofüüsis annab selle olemasolu näärmele ülesandeks lõpetada prolaktiini tootmine, hormoon, mis aitab kaasa rinnapiima tekkele. Gonadotropiini vabastav hormoon saadetakse puberteedieas hüpofüüsi. See hormoon juhendab hüpofüüsi tootma gonadotropiini, mis omakorda stimuleerib meestel testosterooni ning naistel östrogeeni ja progesterooni taseme tõusu.
Hüpofüüs ise on vaid umbes hernetera suurune. Vaatamata oma väikesele suurusele nimetatakse seda nääret tavaliselt “peanäärmeks”, kuna paljusid keha funktsioone reguleerivad hüpofüüsi poolt vabanevad hormoonid. Nääre on keha funktsioonide jaoks ülioluline ja seda kaitseb ajus väike luuline struktuur. Hüpofüüs on endokriinsüsteemi üks peamisi komponente.