Hüpoallergeenne imiku piimasegu on valmistatud viisil, mis vähendab imikutele kalduvust tõsistele allergiatele. Neid soovitatakse tavaliselt imikutele, kelle perekonnas on esinenud raskeid allergiaid või kes on näidanud tugevat allergilist reaktsiooni tavalistele piimasegudele. Mõnikord, kui imikul võib olla valkude suhtes märkimisväärne allergia, kasutatakse kokkupuute vältimiseks hüpoallergeenset imiku piimasegu, kuna kokkupuute edasilükkamine võib olla vahend allergiate ennetamiseks.
Hüpoallergeenseid imiku piimasegusid on erinevaid. Kaks peamist rühma on hüdrolüüsitud ja vabad aminohapped. Hüdrolüüsitud tüübid käsitlevad valgu töötlemist valemis ja neid on kahte alatüüpi. Mõned neist valemitest on osaliselt hüdrolüüsitud, mis tähendab, et tootjad lõhuvad valguahelaid, kuid jätavad siiski üsna suured ahelad. Need piimasegud võivad mõnele imikule sobida, kuid sellised organisatsioonid nagu Ameerika Pediaatriaakadeemia (AAP) viitavad sellele, et osaline hüdrolüüs ei anna tegelikult täiesti hüpoallergeenset imiku piimasegu.
Selle asemel on soovitatav otsida ulatuslikult hüdrolüüsitud valemit. Seda tüüpi valguahelad on palju väiksemad, mistõttu on palju tõenäolisem, et imikud suudavad neid seedida ilma allergiat esile kutsumata. Selle alternatiiviks on kasutada valemit, mis sisaldab ainult aminohappeid, mida ei moodustata valgurühmadeks. Neid nimetatakse vabade aminohapete piimasegudeks ja koos ulatuslikult hüdrolüüsitud piimasegudega on need ainult kahte tüüpi piimasegusid, mida AAP ja teised rühmad peavad tõeliselt hüpoallergeense imiku piimasegu näideteks.
Irooniline, hüpoallergeenne imiku piimasegu võib olla saadud piimatoodetest, kuid neid on põhjalikult töödeldud ja need ei põhjusta tavaliselt allergiat. Mõned piimatalumatuse või allergiaga imikud taluvad hästi piimasegusid, mis lihtsalt ei sisalda üldse piimatooteid, nagu sojasegu. On näidatud, et mõned raskete allergiatega imikud ei seedi sojasegusid kuigi hästi, kuigi on vähem tõenäoline, et need põhjustavad eluohtlikke reaktsioone, nagu anafülaktilised allergilised reaktsioonid.
Üks raskusi lapsele hüpoallergeense imiku piimasegu andmisel on see, et nende piimasegude hind võib olla väga kõrge, tavaliselt vähemalt kahekordne ja sageli kolmekordne standardse piimasegu hind. Meditsiinilistel põhjustel on mõnikord võimalik saada kindlustushüvitist lapse toitmise eest nende piimasegudega. Kui on näidatud, et lapsel on sellele eluohtlikud reaktsioonid, on oluline mitte toita last tavalise piimaseguga.
Teine alternatiiv võib olla rinnapiima andmine piimadoonorilt, kui emal on võimatu last rinnaga toita, kuna paljud imikud ei reageeri rinnapiima valkudele samal viisil kui piimasegudes sisalduvatele valkudele. Sellised rühmad nagu AAP rõhutavad imetavate imikute tähtsust, kellel on tõenäoliselt allergia, kuid see ei ole kõigil juhtudel võimalik. Kui see pole teostatav, pöördub enamik inimesi hüpoallergeense imiku piimasegu poole ja kui nende kindlustuspoliis seda ei kata, võivad inimesed eeldada, et lapse toitmise kulud on märkimisväärsed.