Geneetiliselt muundatud (GM) toit on tekitanud poleemikat teadlaste, keskkonnakaitsjate ja majandusaktivistide seas. GM-toitu kasvatatakse taimedest, mille geenid on konstrueeritud muutma nende keemiat või bioloogiat, et tagada vastupanuvõime põuale, putukate nakatumisele, haigustele ning muuta saadud toit vitamiini- ja mineraalainerikkamaks, suuremaks, maitsvamaks või pikema säilivusajaga.
Geneetiliselt muundatud toitude biotehnoloogia on vastuoluline vastaste jaoks, kes kardavad selle mõju inimeste tervisele ja keskkonnale. Näiteks mõtlevad nad, mida tähendab mittesöödava looma- või taimeliigi geenide kasutamine söödavas looma- või taimeliigis, isegi kui see toode sisaldab rohkem vitamiine või mineraalaineid ja tundub tervislikum. See on peamine erinevus geneetiliselt muundatud toidukultuuride ja põllukultuuride vahel, mis on maitse, vastupidavuse või hooldamise hõlbustamise tõttu selektiivselt aretatud, nagu mais või veised. Näiteks teatud kalades olev kemikaal, mis võimaldab neil sügavale külma vette sukelduda, aitab nüüd maasikataimedel kergeid külmasid vastu pidada. Bioinseneri olulisust või pikaajalisi mõjusid ei ole täielikult hinnatud, kuigi riske pole veel tuvastatud.
Teiseks on geneetiliselt muundatud toidu kasvatamine vastuoluline põllumajandustootjate jaoks, kes on mures selle pärast, et kasvatajad ei suuda hoida ära geneetiliselt muundatud toitu tootvate transgeensete taimede õietolmu levikut ja väetamist metsikute või mittetransgeensete liikide eest. Need oponendid juhivad tähelepanu kahjule, mis võib tekkida, kui geneetiliselt muundatud liikide tüved lekivad loodusesse ja rikuvad taimede ökosüsteemi loomulikku tasakaalu. Kas hübriidliigid ei taluks enam teatud tüüpi nakatumist, kuna need on loodud ilma mürgita? Kas nad võivad muutuda paljunemisvõimetuks? Bioinsenerid väidavad, et risttolmlemine kujutab endast ebaolulist ohtu, kuna õietolm peab liikuma pika vahemaa üle geneetiliselt muundatud põllukultuuride ja teiste liikide vahele rajatud vallikraavide ning selliseid lekkeid pole toimunud.
Rahvusvahelised majandusmured on tekitanud arengumaade majanduse eestkõnelejate seas vastuolulisi reaktsioone. Kui suurkorporatsioon suudab suure uurimis- ja arendusosakonnaga toidukultuuridega manipuleerida, kindlustavad nad endale fantastiliselt eduka geneetiliselt muundatud toidu. Mõned ütlevad, et see annab neile ebaõiglase eelise põllumeeste traditsiooniliste põlluharimismeetodite ees, mis omakorda loob pikaajalise sõltuvuse ettevõttest. Näiteks valmistas üks ettevõte riisi, mis sisaldas rohkem vitamiine, suuremat vastupidavust ja hõlpsamat kasvu. Nad müüvad seemneid, mis ise ei paljune, kuna taimed olid viljatud, mis tähendab, et põllumehed peavad igal hooajal seemneid ostma. Mõned usuvad, et see loob arengumaade tarbetu sõltuvuse mõnest hiiglaslikust korporatsioonist, kes varustavad aasta-aastalt kõik seemned ja herbitsiidid, et saada kasu geneetiliselt muundatud toidust. Teised peavad seda rahvusvahelise kapitalistliku süsteemi loomulikuks jätkuks, mis vajab hoolikat reguleerimist, kuid millel puuduvad sisemised probleemid.