Mõnikord võib olla vajalik, et teatud keharakud läbivad programmeeritud enesehävitamise protsessis, mida nimetatakse apoptoosiks. Rakud võivad apoptoosi läbi viia vastusena infektsioonile või kahjustusele või lihtsalt osana üldisest koe kasvust. Selle programmeeritud surma aktiveerib signaaliülekande rada, mille käivitab spetsiaalne valk, mida nimetatakse Fas ligandiks. Teine valk, mida nimetatakse Fas-retseptoriks, eksisteerib paljude rakkude pinnal ja on koht, kus see ligand saab dokkida ja esile kutsuda enesehävitusreaktsiooni. Selle raja muutused, mis hõlmavad seost retseptori ja ligandi vahel, võivad olla seotud mõne haigusseisundiga.
Fas-retseptori sidumine võimaldab aktiveerida programmeeritud rakusurma aktiivsust. Fas ligandid sisaldavad kolme piirkonda, mis kõik peavad selle protsessi käivitamiseks kinnituma rakupinna vastavate piirkondadega. Pärast seda edastab Fas-retseptor signaalid mõjutatud raku sisemusse ja teised valgupiirkonnad, mida nimetatakse surmadomeenideks, ühinevad ligandi ja retseptoriga, moodustades kompleksi. Seejärel see kompleks aktiveerib ja vabastab ühendeid, mida nimetatakse kaspaasideks, tappes raku.
Immuunsüsteemi õige toimimine sõltub vähemalt osaliselt Fas-retseptori olemasolust rakkudes. Nakatunud rakud ja teatud immuunrakud, mida nimetatakse lümfotsüütideks, mida keha enam ei vaja, saab apoptoosi käigus kontrollitult hävitada. Seejärel saab keha nende koostismolekule uuesti kasutada või vajaduse korral kõrvaldada. Immuunsüsteemi tuvastamisel kasutavad valged verelibled, mida nimetatakse T-rakkudeks, Fas ligandi, et muuta Fas-retseptor surmale suunatud rakkudel aktiivseks vormiks, kusjuures ligand suudab ära tunda kolm piirkonda. Seejärel toimub sidumine, nii et need mittevajalikud või potentsiaalselt kahjulikud rakud saab kõrvaldada viisil, mis üldiselt ei kahjusta läheduses asuvaid rakke.
Teatud haigusseisundid võivad hõlmata Fas-retseptori ja selle ligandi vahelise normaalse suhte katkemist. Kasvajarakud võivad tekitada ebaharilikult suures koguses ligandi valku, mis võib seejärel kahjustada lähedalasuvaid rakke, toota kasvaja jaoks rohkem toitaineid ning takistades immuunsüsteemil seda kahjustada. Autoimmuunpuudulikkuse sündroom (AIDS) võib põhjustada valgete vereliblede hävitamise nende rakkude Fas-retseptorite ebaõige aktiveerimise tõttu. AIDSi progresseerumise ajal näib apoptoosi rada kergemini käivitatavat, mis võib tuleneda tundlikkusest selle aktiveerimise suhtes.