Epifenomen on meditsiiniliselt sekundaarne või täiendav sümptom, mis tekib patsiendil haiguse käigus ja mis võib, aga ei pruugi olla seotud kõnealuse haigusega. See võib viidata ka sekundaarsele sümptomile või muule sündmusele, mis võib varjata uuritavat tõelist põhjuse-tagajärje seost. Näiteks võib ravim tunduda suurendavat teatud haiguse riski, kuid tegelikult võib see haigusseisund, mis oli ravimi võtmise põhjuseks, olla see, mis suurendab haiguse riski.
Väljaspool meditsiinikeskkonda esinevate epifenomenide levinud definitsioonis viidatakse tavaliselt sellele, et epifenomeni põhjustab esmane nähtus – praegu uuritav nähtus. Tavaliselt viidatakse ka sellele, et epifenomen ei saa mõjutada esmast nähtust. Kumbki neist ei vasta tingimata meditsiinilises määratluses tõele. Meditsiinis esinevad epifenomenid võivad olla põhjustatud kogemata või otseselt esmasest nähtusest, kuigi need võivad, kuid ei pruugi tunduda, et need on sellega seotud. Need võivad olla ka kõnealuse seisundiga täiesti mitteseotud ja tegelikult võivad need olla samaaegse häire sümptomid, st häire, mis ilmneb samal ajal kui praegu uuritav haigus.
Epifenomen, mis ilmneb kliinilises või uurimistöös, võib olla segadusttekitav, sest selle olemasolu muudab põhjuslikud seosed ebaselgeks. Meditsiinitöötajad ja patsiendid võivad olla ebakindlad, kas epifenomen on esmase nähtuse kõrvalmõju või täiesti uus seisund. Nad ei pruugi olla võimelised kindlaks tegema, kas sekundaarne sümptom on põhjustatud haigusest, haiguse raviks kasutatavast ravist või millestki muust, mis ei ole haiguse ja selle raviga seotud. See on eriti keeruline, kui meditsiinitöötajatele või patsiendile on loogiline, et sekundaarne sümptom on seotud esmase seisundiga.
Unenägude nägemine on näide epifenomenist, millest on meditsiiniuuringutes räägitud ja mida on uuritud. On ebaselge, kas unenägude nägemine on lihtsalt une kõrvalsaadus või teenib see iseenesest mingit eesmärki. Et saada rohkem teavet une ja unenägude vahelise seose kohta, vaadeldakse mõnes uuringus unenägusid tavalistel isikutel, võrreldes narkoleptiliste isikute või teiste une- või unenägudega seotud probleemidega inimeste unenägudega. Teadlased peavad olema loomingulised, leidmaks viise unenägude tegeliku põhjusliku seose kindlakstegemiseks, nagu nad peavad olema ka iga epifenomeni põhjusliku seose kindlaksmääramisel.