Endoskoopia koolitusel õpivad meditsiinitöötajad, kuidas teha kindlaks, millal endoskoopia on vajalik, kuidas protseduuri ohutult läbi viia ja kuidas tulemusi tõlgendada. Koolitus võib toimuda stipendiumi või töötoa vormis gastroenteroloogidele ja teistele hooldustöötajatele, kellel võib olla põhjust endoskoopia tellimiseks, näiteks onkoloogid, kes ravivad söögitoru-, mao- või käärsoolevähiga patsiente. Koolitusprogrammil on täpne õppekava, mida järgivad juhendajad ning õpilased saavad stardi alguses infot, mida oodata.
Inimesed peavad olema endoskoopia väljaõppeks kvalifitseeritud arstid. Kursusetöö sisaldab tavaliselt klassiruumi elementi, kus arstid õpivad tundma endoskoopia ajalugu ja praktikat. Tunnis annab juhendaja teavet selle kohta, kuidas endoskoopia töötab, millal seda protseduuri kasutada ja kuidas suhelda patsientidega enne endoskoopiaid. Õpilased võivad teha teste, mis kinnitavad, et nad saavad tunnis käsitletud teemadest aru.
Endoskoopia koolitus võib võimaldada juurdepääsu arvutisimulatsioonile. See võimaldab inimestel endoskoopiatega harjuda patsiente ohtu seadmata. Teised programmid alustavad arstide protseduuride jälgimisega, andes neile järk-järgult võimaluse osaleda ja lõpuks lubades neil protseduure ise teha. Koolituse eesmärk on tagada, et kõik osalejad saaksid endoskoopia protseduuri ohutult ja täpselt läbida.
Koolitus hõlmab ka kursuste töid, mis tutvustavad õpilasi erinevate tingimustega, millega nad võivad kokku puutuda, ja kuidas nad esinevad. Õpilased õpivad tõlgendama leide, nagu värvimuutused, polüübid ja muud kõrvalekalded seedetraktis. Samuti õpivad nad biopsia jaoks proove võtma ja patoloogi läbivaatuseks ette valmistama. Õppehaiglad toetuvad olemasolevate patsientide failidele, et pakkuda arstidele laia valikut endoskoopiate näiteid, et nad saaksid õppida tundma tavalisi anatoomilisi variatsioone ja näha ebatavalisi seisundeid, mida nad praktikas tavaliselt ei kohta.
Endoskoopiakoolitus pakub õpilastele tööriistu, et otsustada, millal see meditsiiniline test tellida ja kuidas endoskoopiast patsientidega rääkida. Arstid peavad suutma rahustada patsiente, kes võivad testiga seoses hirmu tunda. Samuti õpivad nad patsiendi ohutuse ja mugavuse põhiprotokolle. Endoskoopia koolitusel õpetatakse arste sedatsiooni ja valu leevendamiseks ning anestesioloogi või õe anestesioloogiga töötamist, et patsiendid tunneksid end kogu protseduuri vältel mugavalt. Samuti õpivad nad, kuidas säilitada puhtaid tingimusi, tehes koostööd teiste endoskoopiameeskonna liikmetega, et kaitsta patsiente nakkuste eest.