Endomeetrium on limaskest, mis asub emaka sees. See takistab emaka keskmisel kihil, mida nimetatakse müomeetriumiks, adhesioonide teket ja annab platsentale raseduse ajal emaka külge kinnitumise ala. See koosneb epiteelirakkude kihist, mis on sidekoega ühendatud müomeetriumiga.
Endomeetriumi paksus muutub koos naise menstruaaltsükliga. See pakseneb folliikulite tsükli ajal. Just sel perioodil valmistub emakas võimaliku embrüo vastuvõtmiseks. Kui munarakk viljastatakse ja viljastumine toimub, kinnitub platsenta, mille embrüo loob, endomeetriumi seina külge. See ühendus tagab hapniku ja toitainete transportimise emalt embrüole.
Enamiku kuude jooksul munarakk ei viljastu. Nendel kuudel vooder laguneb ja menstruatsiooni käigus eraldub. Seejärel algab tsükkel uuesti, kuna keha valmistub uuesti võimalikuks raseduseks. Kui embrüo on olemas ja implanteerub emakasse, siis endomeetrium ei eraldu, pigem muutub see platsenta osaks, pakkudes nii tuge kui ka toitaineid kogu raseduse ajaks.
Endomeetriumi muutused tekivad hormoonide erineva taseme tõttu. Emaka sisemise kihi paksenemine on tingitud östrogeeni taseme tõusust. Pärast seda, kui munajuhad vabastavad munaraku, tõuseb ka progesterooni tase. See peatab rakkude kogunemise emaka seinale ja valmistab emaka ette võimalikuks embrüole siirdamiseks. Kuudel, mil embrüot pole, langeb progesterooni tase taas ja liigne vooder väljub menstruaaltsükli jooksul.
Mõnikord on endomeetriumi arengus komplikatsioone. Madal hormoonitase takistab mõnikord emaka siseseina paksenemist. Selle füüsiline tagajärg on amenorröa või menstruaaltsükli puudumine. See esineb kõige sagedamini sportlastel või madala keharasvasisaldusega inimestel. Endomeetriumi moodustumise ja eraldumise keskmine tsükkel on 28 päeva, kuid see võib muutuda reaktsioonina stressile, aastaaegadele ning kehakaalu langusele või tõusule.