Eisneri auhind antakse koomiksi- ja graafiliste romaanitööstuse töötajatele. Eisneri auhind on oma nime saanud Will Eisneri järgi, kes on kauaaegne koomiksite ja graafiliste romaanide kirjutaja ja illustreerija. 1980. aastate alguses tunnustas koomiksitööstus Kirby auhindadega oma kunstivormile kaasaaitajaid. Kirbyd olid aga lühiajalised ja Kirby auhindu toetav organisatsioon läks 80ndate keskel laiali. Tundes endiselt graafilise romaani ja ajakirja tunnustamise tähtsust, tulid paljud spetsialistid kokku, et toetada uut organisatsiooni ning igal aastal on paljudel selle valdkonna esindajatel au saada Eisneri auhind.
Esimesed Eisneri auhinna kandidaadid olid kunstnikud ja/või teosed, mis avaldati 1987. aastal ning auhinnatseremoonia toimus 1988. Sellest ajast alates on paljud saanud Eisneri auhinna, mida antakse igal aastal mitmes kategoorias. Praegu antakse igal aastal välja ligikaudu 30 auhinda.