Automaatne käitumine toimub siis, kui kehal näib olevat oma mõistus. Sellistel juhtudel käitub inimene käitumisega, mis on tema kontrolli alt väljas. See käitumine võib hõlmata keha tahtmatuid liigutusi või tahtmatuid verbaalseid ütlusi. Mitmed haigusseisundid ilmnevad automaatse käitumisega, sealhulgas epilepsia, hüpoglükeemia ja mõned unehäired.
Paljudel juhtudel võib juhtuda automaatne käitumine, kui inimene on muutunud teadvuseseisundis. Näiteks on täheldatud, et tõsise unepuudusega inimesed käituvad poolteadvuses olles automaatselt. Demonstreeritud tegevused võivad hõlmata unes rääkimist, unes kõndimist ja kõige äärmuslikumatel juhtudel isegi vägivaldse või mõrvarliku käitumise demonstreerimist: mõrvarlikku somnambulismi. Mõned kuritegudes süüdistatavad isikud on kasutanud kaitseks isegi automatismi, väites, et kuritegu ei olnud teadliku kontrolli all. Mälu puudumine, mida inimesed mõnikord kogevad, toetab arusaama, et käitumine tuleneb teiselt teadvuse tasandilt.
Muudel häiretel võib olla automaatse käitumise komponente. Vigaste närviühenduste tõttu võivad epileptikutel tekkida krambid või muud kontrollimatud liigutused, nagu närimine või neelamine. Tahtmatud kehapuugid või soovimatud sõnalised avaldused iseloomustavad ka Tourette’i sündroomina tuntud häiret. Lisaks hõlmavad mõned skisofreenia vormid katatoonseid seisundeid, mille puhul inimese liikumis- ja teadlikkuse tase on tugevalt piiratud, ning teine pikaajaline automaatse käitumise psühholoogiline seisund – dissotsieeruv fuuga – tekib siis, kui indiviid võtab teatud aja jooksul alateadlikult teise elu ja identiteedi. Lisaks võib deliirium tekkida siis, kui inimese veresuhkru tase langeb drastiliselt, viies ta poolkoomasse seisundisse.
Tavapärasemal tasandil võib isegi refleksiivseid tegevusi vaadelda automaatse käitumise tüübina, kuna neid soodustatakse instinktiivselt. Teine suhteliselt kahjutu automaatne käitumisvorm on automaatne kirjutamine, võime, mida mõned inimesed peavad oma aju alateadlikke mõtteprotsesse automaatsete käeliigutuste abil füüsiliselt kaardistama. Mis puudutab kahjulikke automatismi tüüpe, siis võib neid teatud määral kontrollida ravimite, näiteks krambivastaste ravimitega.
Aju närvivõrkude tõrked võivad automaatse käitumise aluseks olla. Isikute elektroentsefalogrammi (EEG) näidud näitavad rutiinselt kõrvalekaldeid ajulainete mustrites. Teatud juhtudel tekivad need kõrvalekalded siis, kui inimene lülitub kiiresti sügavast unest või teadvuseta olekust erksusse ilma kiire silmade liikumise (REM) unele iseloomulikke keskmisi olekuid leevenemata. Unehäire narkolepsia omab vastupidist mõju, kus inimene liigub erksast seisundist kiiresti sügavasse unne.