Mõistet “aspiratsioon” kasutatakse kahes erinevas meditsiinilises tähenduses. Esimeses mõttes viitab see kopsuaspiratsioonile, mille puhul inimesed imevad võõrkehi hingetorusse ja kopsudesse või lastakse võõrkehi sisse, näiteks ventilaatori abil. Teises mõttes on aspiratsioon teatud tüüpi meditsiiniline protseduur, mille käigus aine imetakse välja või eemaldatakse. Mõeldud tähendus on tavaliselt kontekstist selge.
Kopsuaspiratsioon võib olla väga ohtlik. Üks kopsuaspiratsiooni vorm võib tekkida siis, kui inimesed oksendavad ja osa oksest satub kopsu. Inimesed võivad sisse hingata ka toitu või jooki või võõrkehi, näiteks õhus olevat tolmu. Võõrkehade sissehingamine põhjustab kopsude õrnade kudede ärritust ning võib põhjustada põletikku ja seisundit, mida nimetatakse aspiratsioonipneumooniaks. Midagi aspireerinud patsientide ravi sõltub sellest, mis see on, ja muudest teguritest.
Aspiratsioonirisk on võtmeküsimus, miks inimestel soovitatakse enne üldoperatsiooni söömisest hoiduda. Mure seisneb selles, et patsient võib operatsiooni ajal või vahetult pärast seda oksendada ning tal võib olla oht osa oksendamisest aspireerida. Aspiratsioon tekitab muret ka siis, kui inimesed langevad teadvusetu narkootikumide üledoosi, vigastuse või alkoholi tarvitamise tagajärjel, mis on üks põhjusi, miks ei tohiks inimesi sellistes olukordades üksi jätta.
Aspiratsiooni kui meditsiinilist protseduuri saab teha mitmel viisil. Näiteks aspiratsioonibiopsia puhul kasutatakse proovi võtmiseks vedelikule ligipääsuks nõela ja vedelik imetakse nõela sisse, tõmmates kolbi. Seda tehnikat võib kasutada põiest puhta uriiniproovi võtmiseks, luuüdiproovi võtmiseks või abstsessist vedeliku väljavõtmiseks. Aspiratsiooni võib kasutada ka lima eemaldamiseks ninast ja suust, vere eemaldamiseks operatsioonikohast või vedeliku kogunemise eemaldamiseks kehas.
Mõne aspiratsiooniprotseduuri puhul võib patsient saada anesteesia, kuna see võib olla valus. Muudel juhtudel ei ole anesteetikum vajalik. Näiteks arst, kes kasutab imiku ninast lima eemaldamiseks süstalt, ei pea valuvaigistit andma, sest protseduur ei tohiks olla valulik, samal ajal kui arst, kes võtab luuüdi biopsia, peab kasutama anesteetikumi, et nõel ei ole patsiendi jaoks piinav.