Allogeenne tähendab otsetõlkes sõna homoloogne. Mõlemad on omadussõnad, mis viitavad kudedele, luuüdile või verele mis tahes siirdamise või vereülekande vormis, mis on pärit samast liigist. Need terminid on vastandatud autoloogsele, mis tähendab ühe sellise kudede kasutamist samalt inimeselt samale inimesele. Isikule, kellele siirdatakse või asendatakse kude, tehakse autoloogne protseduur. Kui teostatakse allogeenset siirdamist, pärineb annetatud kude samast liigist, mitte mis tahes muust loomaliigist (ksenograft) või neilt endilt (autoloog).
Enamikul juhtudel on kudede, vere või muud tüüpi rakkude siirdamine allogeenne. See tähendab ikkagi seda, et enne teise kehasse elatu sisestamist peab toimuma teatud vastavus. Isegi vereloovutust tuleb kontrollida, veendumaks, et see ei lähe vastuollu saaja veregrupiga. Autoloogse vere siirdamise tagasilükkamine võib tekkida, kui veri ei ole täielikult sobitatud. See ei tähenda alati, et veregrupid peavad täpselt vastama. O-positiivne veri võib olla võimeline vastu võtma enamikku teist tüüpi verd, kuid O-negatiivne veri saab tavaliselt vastu võtta ainult O-negatiivset verd.
Täpsemat sobitamist võib vaja minna näiteks allogeense luuüdi siirdamise või elundisiirdamise puhul. Seetõttu otsivad arstid sageli pereliikmete seast sobivat vastet luuüdi või elundite jaoks, mida inimesed saaksid annetada täielikult või osaliselt, näiteks neerud või maks. Mida lähemal on matš, seda väiksem on tagasilükkamise tõenäosus. Aeg-ajalt tehakse sobivaid tikke väljaspool lähisugukonda ja teatud elundisiirdamiste puhul tehakse peaaegu alati tikud väljaspool perekonda, näiteks südamesiirdamine.
Tuleb mõista, et olenemata sellest, kas siirdamine või vereülekanne pärineb inimese perekonnast või ilma selleta, on see allogeenne, kui see pärineb teiselt inimeselt. Kui see pärineb konkreetselt siirdamist/ülekannet vajavalt inimeselt, kirjeldatakse seda teisiti. Võtame näiteks inimese, kellele ei saa verd siirdada. Sel juhul võib kirurg otsustada koguda operatsiooni ajal kaotatud vere ja viia see uuesti inimese kehasse. See oleks autoloogne.
Samamoodi võib luuüdi kogumine sünnihetkel, tavaliselt nööri kogumise teel, anda inimestele, kellel hiljem tekib vähk, võimaluse kasutada oma luuüdi. See sobiks ideaalselt. See ei oleks allogeenne, vaid oleks autoloogne. Munarakkude kogumist hilisemaks viljastamiseks võib samuti pidada autoloogseks, kuigi pärast viljastamist on need ka allogeensed, sisaldades täiendava inimese geneetilist materjali.
Lihtsamalt öeldes homoloogne või allogeenne keskmine samast liigist. Doonor võib, aga ei pruugi olla lähisugulane. Geneetika tihe vastavus on tavaliselt endiselt väga oluline, kuid see ei tähenda seost. Kaks asja, mida homoloog ei saa olla, on mina või teise liigi liige.