Mis on algoritmiline botaanika?

Distsipliinina, mis on pühendatud virtuaalsete vahendite kasutamisele taimede ja taimede kohta teadmistepanga suurendamiseks, annab algoritmiline botaanika botaanikutele arvutitööriistade kasutamise, et uurida ja simuleerida erinevaid taimedega seotud stsenaariume. See virtuaalsete tööriistade kasutamine virtuaalsete taimede uurimiseks on juba pälvinud suurt tähelepanu ja see on Calgary ülikooli suuremate õppeainete keskmes.

Algoritmilise botaanika protsessi väljendatakse kõige paremini bioloogilise modelleerimise ja visualiseerimisena, mida rohkem tuntakse kui BMV-lähenemist. Just see lähenemine on aluseks uuringutele, mida praegu Calgary ülikooli arvutiteaduse osakonna egiidi all tehakse. Põhimõtteliselt töötatakse algoritmilise botaanika mudelid välja arvutiteaduse tehnoloogia abil, mida kombineeritakse erinevat tüüpi tarkvaraga, et luua virtuaalne labor, kus virtuaalseid taimi kasvatatakse rangetes ja kontrollitud olukordades. Võimalus käivitada samaaegselt mitmeid erinevaid simulatsioone aitab uurimisprotsessi oluliselt kiirendada. Algoritmiline botaanika loob olukorra, kus botaanikutel on vabadus uurida võimalusi väga lühikese aja jooksul, mitte aastate või aastakümnete jooksul, mida sarnased jõupingutused reaalses elus eeldaksid.

Calgary ülikooli BMV teadlaste rühmad ei ole oma töös üksi. Projekti on erinevatel tasanditel kaasatud inimesi üle maailma. Töö jaguneb põhimõtteliselt kolmeks põhikomponendiks. Modelleerimine on põhikomponent ja hõlmab virtuaalsete taimede aluse loomist. Simulatsioon põhineb modelleerimisel loodud alusel ja võimaldab teadlastel tutvustada iga mudeli virtuaalsesse keskkonda erinevaid kontrollitavaid tegureid. Taimede visualiseerimine võimaldab uurida lõpptoodet, mis saadakse kasutusele võetud tegurite seeria abil, pakkudes väärtuslikku teavet nende tegurite kasutamise teostatavuse ja soovitavuse kohta reaalses rakenduses.

2007. aasta novembris kogunesid algoritmilise botaanika edenemisest huvitatud inimesed viiendale iga-aastasele taimede funktsionaalse-struktuurse modelleerimise seminarile. Uus-Meremaal Napieris peetud töötuba oli avatud Calgary ülikooli projektiga seotud inimestele, aga ka sõltumatutele teadlastele, kes kasutasid oma jõupingutustes mingit algoritmilist botaanikat.