Alglaadimissektori viirus on viirus, mis paigutab oma koodid ja käsud arvuti DOS-i alglaadimissektorisse ehk Master Boot Record (MBR). Kui seda tüüpi viirus on süsteemi nakatanud, on MBR tavaliselt rikutud ja arvuti alglaadimisjärjestus muudetakse. Alglaadimissektori viirused võivad olla ohtlikud ja vohavad, kuna need laaditakse arvutisse iga kord, kui arvuti käivitub, ja aja jooksul võivad nad levida teistele loetavatele ketastele. Käivitus- ja käivitusprobleemid, probleemid andmete toomisega, arvuti jõudluse ebastabiilsus ja suutmatus leida kõvakettaid on kõik probleemid, mis võivad tekkida infektsiooni tõttu.
Üks peamisi viise, kuidas seda tüüpi viirused on ajalooliselt arvuteid nakatanud, on diskettide kaudu. Tänu tehnoloogilistele edusammudele ei pea need kettad süsteemi kahjustamiseks olema vanamoodsad alglaaditavad kettad; need võivad olla keskmised kettad, mis on arvuti käivitamisel draividesse jäetud. Viirus võib jõudsalt areneda ka jagatud võrkudes, kus vahetatakse faile ja levitatakse meilimanuseid.
Õnneks on alglaadimissektori viiruse eemaldamine lihtne ning enamik viirusetõrjetarkvarasid suudab viiruse kiiresti ja tõhusalt eemaldada. Arvutikasutajatel on oluline veenduda, et viirusetõrjetarkvara on viiruse täielikult eemaldanud. Selle eiramine võib kaasa tuua osalise eemaldamise, mis võib mõjutada kõvaketta teist osa. Viirusetõrjetarkvarasse investeerimine võib samuti aidata kaitsta andmeid ja faile eemaldamisprotsessi ajal.
Nakatumise ennetamine on samuti lihtne. Kasutajad peaksid vältima diskettide jagamist ja tarkvara allalaadimist tundmatutest allikatest, kuna viirus võib edasi kanduda mõlemal viisil. Ketaste eemaldamine draividest enne arvuti käivitamist võib samuti säästa kasutajat nakatumise eest, kuna viirus võib asuda disketil. Reaalajas viirusetõrjetarkvara installimine, mis hindab aktiivselt masinat ähvardavaid ohte, võib samuti aidata rünnakuid ära hoida.
Kõik kasutajad peaksid olema valmis igasuguseks viiruserünnakuks. Üldiselt on hea mõte faile regulaarselt varundada. Süsteemi ketaste lukus hoidmine, et viirused ei saaks neid kirjutada, võib kaitsta kettaid soovimatu sissetungi eest. Kõigi allalaaditud rakenduste kontrollimine viiruste suhtes enne installimist ja diskettide lukustamine enne nende kasutamist kolmanda osapoole arvutis võib samuti hoida kasutaja personaalarvuti viirusevabana.