Ajutüve anatoomia vastutab põhiliste elufunktsioonide eest. See hõlmab keskaju, silda ja piklikku medulla. Ajutüve anatoomia on kehaosa, mis ühendab aju seljaaju ja ülejäänud närvisüsteemiga. Hingamine, vererõhk ja seedimine on funktsioonid, mida juhib ajutüve osana sisalduv anatoomia.
Nägemist ja kuulmist kontrollib ajutüve keskaju osa, mis asub otse ajukoore all. Selles ajupiirkonnas paikneb basaalganglionide mustaine. Selles piirkonnas toodetakse dopamiini ja piirkond kontrollib ka liikumist. Keskaju punane tuum suhtleb motoorsete neuronitega. Teadvust ja erksust juhitakse selles osas paikneva retikulaarse moodustise kaudu.
Ajutüve anatoomias on keskajust veelgi allpool silla piirkond. Siin töödeldakse kuulmissensoorse teabe tõlgendamist. Sillal on ka ühendused väikeajuga ja see mõjutab liikumist. Silla struktuuri esmane ülesanne on ühendada ajukoor ja piklik medulla. Vajalikke automaatseid funktsioone, nagu uni, hingamine, haigutamine ja pilgutamine, reguleeritakse selle jaotisega ühendatavatest struktuuridest.
Kolmas suur osa ajutüve anatoomiast on medulla piklik. See on ajutüve alumine osa ja kontrollib oksendamise, südame- ja verefunktsiooni ning seedimise reguleerimist. Medulla oblongata on kaks peamist osa, mida tuntakse ülemise ja madalamana. Konstruktsiooni alumine osa ühendub otse seljaaju ülaosa närvidega. Siit läbib verevool, et jõuda ülejäänud ajuni ja varustada neid hapnikuga.
Kraniaalnärvi kimbud on samuti osa ajutüve anatoomiast. Erinevad närvid ühenduvad erinevate osadega ja suured kimbud juhivad igaüks aju ja keha konkreetseid funktsioone. Iga osa kontrollib motoorseid oskusi, tõlgendab sensoorset teavet ja suhtleb väikeajuga.
Haigused ja kahjustused võivad mõjutada ajutüve anatoomiat, põhjustades peavalu, kõneprobleeme, näo longust ja kuulmislangust. Kasvajaid diagnoositakse magnetresonantstomograafia (MRI) abil. Piirkonnas esinevad haigused põhjustavad lihasnõrkust, peapööritust ja neelamisprobleeme. Enamik kraniaalnärve on ühendatud ajutüve kaudu, seega on selle piirkonna probleemid väga tõsised ja võivad põhjustada suuri eluhäireid.