Sündmusi, mis tipnesid USA 16. presidendi Abraham Lincolni mõrvaga, tuntakse Lincolni vandenõuna. See vandenõu puudutab selle peamise kihutaja, Shakespeare’i näitleja ja lõuna pooldaja John Wilkes Boothi mõrvarlikke mahhinatsioone. Tema järgijate seltskond nõustus tema plaaniga vabastada liit ühe hoobiga kõigist selle liidritest. 14. aprillil 1865 kell 10 pidid Ulysses S. Grant, Abraham Lincoln, asepresident Andrew Johnson ja välisminister William Seward kõik Boothi ja tema kaasosaliste käe läbi surema, kuid nagu see on ka hiirte ja meeste parimad skeemid, läks kõik valesti.
Lincolni vandenõu sai alguse presidendi röövimise plaanist vahetult pärast tema teist ametisseastumist. Algselt kavandas Booth Lincolni röövimist, Richmondi lõunapealinnas vangis hoidmist ja liidu erinevates vanglates vangistatud konföderatsiooni sõdurite vastu vahetamist. Plaan nurjus ja peagi muutus vandenõu inimrööviplaanist mõrvaks. Türkiv ja vihane mees Booth vihkas seda, mida ta nimetas presidendi “põhjapoolseks abolitsionismiks” ja pidas sõjaseisukorra väljakuulutamist oma koduosariigis Marylandis täitevvõimu selgeks kuritarvitamiseks.
Plaani kohaselt pidi kindral Ulysses S. Grant osalema sel aprilliõhtul Fordi teatris etendusel “Meie Ameerika nõbu”, kuid tema naise Julia ja Mary Todd Lincolni vaheline tüli takistas neil osaleda. Riigisekretäri William Sewardi elu päästis kaelatugi, mida ta oli sunnitud kandma veoõnnetuse tõttu; see tõrjus löögid Boothi kaasosalise käes olevast noast. Teine vandenõu kaasosaline, kellele tehti ülesandeks tappa asepresident Johnson tema Kirkwood House’i elukohas, ei püüdnud seda teha.
Booth pääses teatrist, kuid sõdurid leidsid talle jälile ja suri 26. aprillil kuulihaava. Veel neli Lincolni vandenõu liiget, sealhulgas esimene USA-s pootud naine Mary Surratt, poodi üles 7. juulil ehk nädal pärast sõjaväekomisjoni poolt süüdimõistmist. Ülejäänud neljale määrati vanglakaristus, kolmele eluaegne vanglakaristus.
Üks vaidlusi tekitanud oli dr Samuel Mudd, kes algul eitas teadmist, kes Booth oli, kui ta pahkluu mõrvaõhtul presidendi rõdult lavale hüpates murdus. Mudd tunnistas hiljem, et oli Boothiga korra varem kohtunud. Dr Mudd mõisteti mõrvas osalemise eest Devil’s Islandil eluks ajaks vangi. Ta teenis palju aastaid enne armuandmist ja väljend “tema nimi oli muda” tuleneb selle mehe raskest olukorrast.