Kui räägitakse virtuaalsetest privaatvõrkudest (VPN), kulub palju aega nende eeliste ülistamisele. Seetõttu võivad paljud nende jaoks uued inimesed tunda end tehnoloogiale omaste puuduste osas teadmatuses. VPN-idel on mõned ühised lõksud, kuid paljud inimesed leiavad, et nende võrkude olulised eelised on väärt oma võimalike raskustega toimetulekut.
VPN-i üks puudus on asjaolu, et selle kasutuselevõtt nõuab kõrgetasemelisi teadmisi ja arusaamist sellistest teguritest nagu avaliku võrgu turvalisus. VPN-turvalisus nõuab parooli ja andmete krüptimist. Turvalisuse suurendamiseks võib võrguaadresse ka krüpteerida. Turva- ja kasutuselevõtuprobleemide vältimiseks on vajalik planeerimine ja tuleb võtta asjakohaseid ettevaatusabinõusid.
Teine oluline puudus on see, et selle kättesaadavust ja jõudlust on raske kontrollida. Tavaliselt on VPN-i kiirus palju aeglasem kui traditsioonilise ühenduse puhul. Mõnikord tundub, et mõned võrgud on ka ühenduvuse osas pisut segased. Erinevatel põhjustel võib kasutajatel olla aeg-ajalt raske VPN-is püsida. Kuigi see võib olla tüütu, kaalub selle pakutav turvalisus sageli üles aeg-ajalt ühendusprobleemidest põhjustatud leina.
Kuigi on tõsi, et VPN töötab paljude erinevate tootjate seadmetega, võivad erinevate loojate tehnoloogiad koos halvasti töötada. Aja jooksul võib see olukord paraneda. Praegu võib see aga VPN-i juurutamisel frustratsiooni tekitada.
Üks VPN-i nõrgemaid lülisid võivad mõnel juhul olla selle kasutajad. Kui kaugtööline või töötaja loob sülearvuti või koduarvuti VPN-i kaudu ühenduse oma ettevõtte kontoriga, võivad tulemuseks olla turvaohud. Seda seetõttu, et töötajad või kaugtöölised võivad lisaks kontoriga ühenduse loomisele kasutada oma personaalarvuteid ka mitmesuguste muude rakenduste jaoks. Sellisena võib ettevõtte võrk töötaja personaalarvuti turvanõrkuste tõttu olla rünnakute suhtes haavatav. Sel põhjusel soovitavad mõned eksperdid varustada kaugtöölisi ja töötajaid koduarvutitega, mis kuuluvad ettevõttele ja mida kasutatakse ainult ettevõtte heakskiidetud eesmärkidel.