Erinevad seisundid võivad põhjustada söögitoru kahjustusi, põhjustades valulikku neelamist ja üldist ebamugavustunnet. Gastroösofageaalne reflukshaigus, mida sageli nimetatakse GERD-ks või happe refluksiks, on söögitoru limaskesta kahjustuste üks levinumaid põhjuseid. Teine seisund, mis võib põhjustada probleeme söögitorus, on buliimia, kuna selle söömishäire all kannatavad inimesed sunnivad regulaarselt toitu ja maohapet kurku sisenema. Loomulikult ei ole pikaajalised seisundid ainus söögitoru kahjustuse põhjus, sest ohtlike kemikaalide allaneelamine võib anda sama tulemuse.
GERD põhjustab maohapete tõusu maost söögitorusse, mis tavaliselt põhjustab kõrvetisi. Kahjuks jääb seda seisundit sageli aastaid ravimata, mille tulemuseks on söögitoru kahjustus, mis on tingitud maohappest, mis aja jooksul limaskesta põletab. Enamikul GERD-ga inimestel tekivad kõrvetised vähemalt kaks korda nädalas ja kui see kestab aastaid, on tulemuseks söögitoru limaskesta põletik, mis võib olla üsna valus. Probleemi saab ära hoida, hoides eemale vürtsikast toidust, vältides söömist vahetult enne pikali heitmist ja süües väiksemaid eineid. Rasketel juhtudel, mida need näpunäited ei aita, võib olla vaja retseptiravimeid.
Söömishäired kahjustavad tavaliselt keha üldiselt, kuid eriti buliimia võib aja jooksul hävitada söögitoru limaskesta. Seda seetõttu, et buliimikud sunnivad end oksendama, mille tulemusena satub söögitorusse nii toit kui ka maohape. Nagu GERD, võib see limaskesta järk-järgult põletada ja põhjustada ebamugavust, mis nõuab paljudel juhtudel ravimite kasutamist. Kahjuks peavad nad isegi siis, kui buliimikud paranevad, sageli tegelema püsivate söögitoru kahjustustega, eriti pärast aastatepikkust puhastamist. Need, kellel on eriti raske haigusjuht, ei pruugi isegi iseseisvalt neelata, mistõttu on probleemi varajane ravi sageli oluline.
Isegi need, kellel pole tervislikke seisundeid või toitumishäireid, võivad kogeda söögitoru kahjustusi, kuna kahjulike kemikaalide allaneelamine võib põhjustada limaskesta põletikku. See võib juhtuda, kui lapsed kogemata kasutavad puhastusvahendeid, kuigi mõned täiskasvanud võivad seda kogeda ka sel viisil enesetapukatsel. Limaskest muutub tavaliselt põletikuliseks, surnud kude tuleb maha ja tekivad haavandid, mis raskendavad sülje või toidu neelamist. Tõsistele juhtudele viitavad tavaliselt verine oksendamine, mis sisaldab söögitoru kude, kõnevõimetus ja kõrisev heli kurgus. Kohene ravi hõlmab tavaliselt ravimeid turse kontrollimiseks, samuti antibiootikume infektsiooni vältimiseks ja veenisiseseid vedelikke, et vältida dehüdratsiooni ja alatoitumist.