Septikusüsteeme kasutatakse seal, kus olmevee jäätmekäitlus puudub. Kuna septikud on terve majapidamise jaoks üliolulised, on septikute töötlemine hädavajalik. Septikute puhastamist on mitut tüüpi, kuid kõige tõhusam võib olla regulaarne pumpamine kvalifitseeritud septikutega. Alternatiivsed ravimeetodid hõlmavad bioloogilisi lisandeid, mis on loodud “heade bakterite” lisamiseks septikusse.
Septiku õigeks töötlemiseks on vaja teada, kuidas protsess toimib, kus asub kontrollportaal ja milline on kasutusel oleva pinnase seisukord. Septikud koosnevad septikust ja äravooluväljadest. Tualettruumidest – nn must vesi – ja kraanikaussidest, duššidest, pesumasinatest – nn hall vesi – voolab septikusse. Tahked jäätmed vajuvad paagi põhja, tekitades muda, samal ajal kui vedelad jäätmed voolavad välja äravooluväljadele. Drenaaživäljad on mitmed kruusaga vooderdatud maa-alused kaevikud, mis töötlevad jäätmeid orgaaniliselt. Kasulikud mikroorganismid pinnases lagundavad baktereid, viirusi ja muid patogeene, kui jäätmed imbuvad ülespoole. Septilise süsteemi töötlemine tähendab selle jäätmekäitlusprotsessi õiget toimimist.
Õige hooldus on sageli parim septikupaagi töötlemine. Septiku väljapumpamise ajakava kindlaksmääramiseks on üldiselt vajalik nii septiku kui ka äravooluväljade regulaarne kontroll. See ajakava sõltub septiku suurusest, maja elanike arvust, päevas kasutatava vee kogusest ja tahkete ainete kogusest reovees. Septikusüsteemi tuleb tühjendada sagedamini, kuna rohkem inimesi viskab ära rohkem tahkeid aineid ja kasutab iga päev rohkem vett, eriti kui paak on väike.
Ennetamine võib olla septikute töötlemise oluline osa. Mõned ennetusmeetodid hõlmavad prügi kõrvaldamise piiramist tahkete ainete koguse vähendamiseks, veekasutuse vähendamist miinimumini ja veekasutuse jaotamist mitme päeva peale, selle asemel, et ühel päeval oleks suur kogus ja järgmisel mitte. Muud tehnikad võivad hõlmata vett säästvate seadmete ja suure tõhususega tualettruumide kasutamist, lekete parandamist ja vee säästmist kiire suplemisega. Mõned koduomanikud kasutavad valamute ja tualettide puhastamiseks söögisoodat või pehmeid puhastusvahendeid, kuna kaubanduslikud puhastusvahendid võivad tappa kasulikke baktereid, mis tegelikult aitavad säilitada septilist süsteemi. Samuti on soovitatav mitte kunagi sõita ega parkida septiku- või äravooluväljakutele.
Paljud septikute puhastusettevõtted väidavad, et septikusüsteemi lisandid lahustavad septikus olevad tahked ained ja muudavad pumpamise tarbetuks, kuid paljud keskkonnaeksperdid nõustuvad, et septiku väljapumpamine on vajalik. Tavaliselt on soovitatav iga-aastane ülevaatus ja pumpamine iga kolme kuni viie aasta järel.