Arvatakse, et kreeka jogurtis sisalduvad probiootikumid parandavad seedimist, suurendavad immuunsust infektsioonide vastu, hoiavad ära allergiaid ja lahendavad ebaregulaarset roojamist. Piimasuhkur on probiootikumide olemasolul kergemini seeditav, aidates laktoositalumatusega inimestel saada Kreeka jogurtiga seotud tervisega seotud eeliseid ilma ebamugavate kõrvalmõjudeta. Käärsoolevähi riski saab vähendada ka kreeka jogurtis leiduvate probiootikumide tarbimisega; jätkuvad uuringud selles valdkonnas püüavad aga kinnitada, mil määral see tõsi on.
Kreeka jogurt sisaldab suuremas kontsentratsioonis probiootikume kui tavaline jogurt, seega suureneb probiootikumide kasulik toime. Need terved bakterid elavad seedetraktis, aidates hoida soolestikku tervena ja korralikult funktsioneerida. Terves soolestikus võib elada umbes 10 triljonit bakterit ja Kreeka jogurt aitab neid täiendada. Kui tavaline jogurt sisaldab ainult kahte erinevat tüüpi kasulikke baktereid, siis Kreeka jogurt sisaldab kuni kuut tüüpi, mis kõik aitavad kaasa tervele soolestikule.
Probiootikumid on eriti kasulikud inimestele, kes ei talu piimatooteid, kes ei suuda toota ensüümi nimega laktaas, mis aitab lagundada piimas leiduvaid süsivesikuid. Kreeka jogurtis sisalduvad probiootikumid toodavad ise laktaasi, mis lagundab piima, muutes piimatooted kergemini seeditavaks. Piimatoodete talumatuse all kannatavad inimesed saavad seetõttu nautida kreeka jogurti tervisega seotud eeliseid ilma ebamugavate kõrvalmõjudeta.
Uuringud on näidanud, et kreeka jogurtis sisalduvatel probiootikumidel on soolestiku tervisele kasulik mõju. See võib olla kasulik näiteks miljonite vaesuses kannatavate laste kõhulahtisuse raviks üle maailma. Probiootikume saab kasutada ka põletikulise soolehaiguse, ärritunud soole sündroomi ja kõhukinnisuse sümptomite leevendamiseks.
Kreeka jogurtis sisalduvad probiootikumid võivad aidata ennetada allergilisi reaktsioone ja on kasulikud näiteks laste äärmuslike allergiliste reaktsioonide ennetamisel. Viimastel aastatel on allergiad sagenenud ja Kreeka jogurtis leiduvatel probiootikumidel võib olla oma roll nende levimuse leevendamisel. Käärsoolevähi riski saab potentsiaalselt vähendada probiootikumide, näiteks kreeka jogurtis leiduvate, söömisega. Uuringud on näidanud, et kasvajate esinemissagedus väheneb probiootikumide sissevõtmise tõttu, kuid täiendavad uuringud püüavad seda kinnitada.
Probiootikume sisaldav Kreeka jogurt on toitev ning kaltsiumi- ja valgurikas. Toitaineid, nagu foolhape, riboflaviin ja vitamiin B12, suurendavad Kreeka jogurtis sisalduvad bakterid. Loomade ja inimestega tehtud uuringute põhjal on väidetud, et kreeka jogurtis sisalduvad probiootikumid aitavad tugevdada immuunsüsteemi. See on eriti kasulik neile, kellel on nõrk immuunsüsteem, näiteks haiged või eakad.