Õhuke emaka limaskesta põhjustab tavaliselt ebapiisav verevarustus, madal östrogeeni tase või emaka kahjustus. Loomulik vananemisprotsess võib põhjustada ka emaka limaskesta järkjärgulist hõrenemist. Adenomüoos on seisund, mis võib põhjustada emaka normaalsest õhema limaskesta. See põhjustab emaka lihaste limaskesta kasvu ja arenemist ning seda esineb sagedamini vanematel naistel.
Ebapiisav verevarustus on õhukese emaka limaskesta tavaline põhjus. Mingil põhjusel muutub emaka verevool ebanormaalselt madalaks. Emaka verevoolu on mõnevõrra raske kindlaks teha, kuid mõned arstid on probleemi lahendamiseks proovinud mõnda retseptiravimit. Need ravimid on mõeldud suguelundite verevoolu stimuleerimiseks ja on näidanud mõningast edu.
Madal östrogeenitase on veel üks levinud põhjus, miks emaka limaskesta õhem on. Normaalset östrogeeni taset võivad häirida hormonaalsed muutused, retseptiravimid ja haigused, nagu polütsüstiliste munasarjade sündroom (PCOS). Mõned hormonaalsed muutused on normaalse vananemisprotsessi tagajärg. Need võivad ilmneda puberteedieas, kui menstruaaltsükkel algab esimest korda, ja eluea keskel, kui tsükkel hakkab lõppema.
40ndate keskpaigas kuni hilistes aastates naistel võib loomulikult tekkida õhuke emakalimaskesta. See on tingitud östrogeeni taseme langusest, kui keha siseneb peri- või menopausi. Mõned 30. eluaastate keskpaigas või lõpus olevad naised märkavad ka voodri paksuse loomulikku vähenemist.
Mõnikord on ebanormaalne östrogeeni tase tingitud põhitingimustest. PCOS võib põhjustada meeste ja naiste reproduktiivhormoonide tasakaalustamatust. Seisund põhjustab androgeenide taseme tõusu, mis põhjustab ebaregulaarset menstruaaltsüklit, soovimatuid näokarvu, meeste tüüpi kiilaspäisust, tsüstilise akne ja vaagnavalu. Kui PCOS on diagnoositud, on see ravitav seisund rasestumisvastaste pillide ja muude hormooniregulaatorite kasutamisega.
Emaka kahjustus võib põhjustada limaskesta keskmisest õhemaks muutumist. Armid, põletik ja infektsioon võivad põhjustada verevoolu ebapiisavuse. Armistunud koe eemaldamiseks emakast on välja töötatud meditsiinilised protseduurid, et parandada selle limaskesta paksust.
Adenomüoosina tuntud haigusseisund põhjustab emaka limaskesta akumuleerumist emaka lihastes. Selle tulemusena muutub sisevooder vähem tihedaks või märgatavaks. Adenomüoosil ei ole teadaolevat põhjust, kuid seda täheldatakse tavaliselt vanematel naistel. Tavaliselt on neil naistel sünnivõimet jäänud vaid paar aastat.
Mõned retseptiravimid võivad põhjustada õhukese emaka limaskesta. Kõik ravimid, mis vähendavad östrogeeni taset, võivad seda põhjustada. Nende ravimite pikaajaline kasutamine on tavaliselt seotud õhukese emaka limaskestaga.