Ohtlike jäätmete käitlemine hõlmab kõiki protsesse, mis muudavad ohtliku või potentsiaalselt kahjuliku aine keemilist, füüsikalist või bioloogilist koostist, et muuta see keskkonnale ja inimestele vähem ohtlikuks. Mõned ohtlike jäätmete käitlemise vormid hõlmavad materjalide transpordi ohutumaks muutmist, nende kasutamist energia tootmiseks või neutraliseerimist keemiliste või muude vahenditega. See eritöötlus on oluline keskkonna saastumise ärahoidmiseks.
Põletamine on levinud meetod ohtlike jäätmete töötlemiseks. Seda kasutatakse nii bioloogiliste kui ka mittebioloogiliste esemete puhul. Tugev kuumus muudab paljude esemete keemilist struktuuri ning vabastab rohkem ruumi ka prügilates ja muudes ohtlike jäätmete hoidlates. Mõnel juhul võidakse energia tootmiseks kasutada ohtlike jäätmete põletamist.
Seal on erinevaid kohti, kuhu võib viia jäätmeid põletamiseks. Ahjud, keevkihtseadmed ja vedeliku sissepritseseadmed on kõik spetsiaalsed tööriistad ohtlike jäätmete põletamiseks. Seda tüüpi ohtlike jäätmete töötlemine üldiselt neutraliseerib või hävitab kõik jäätmetes sisalduvad kahjulikud ühendid, muutes need üldiseks kõrvaldamiseks või matmiseks ohutuks. Kui see ei ole võimalik, võib kasutada spetsiaalseid mahuteid või säilitusseadmeid.
Teist tüüpi ohtlike jäätmete töötlemine hõlmab töötlemist või puhastamist keemiliste ainete abil. Seda tüüpi puhastust kasutatakse tavaliselt kanalisatsioonivee puhastamisel. Tahked jäätmed filtreeritakse veest välja ja lisatakse selliseid aineid nagu kloor, et tappa kõik bakterid või muud ohtlikud bioloogilised saasteained. Seejärel vesi filtreeritakse, et eemaldada kõik kemikaalid peale väikeste koguste, et muuta vesi joogikõlbulikuks.
Ohtlike jäätmete käitlemine võib hõlmata ka erinevat tüüpi ohtlike jäätmete nõuetekohast ladustamist ja kõrvaldamist. Kui eset ei saa põletada, näiteks need, mis sisaldavad metalliühendeid, võib ladustamine olla parim ja teostatavaim valik. Ohtlikke jäätmeid võib hoiustada lekke- ja õhukindlates konteinerites ning seejärel matta, ladustada prügilasse või paigutada muusse spetsiaalsesse kohta. Muul ajal hoitakse neid seni, kuni neid saab filtreerida ja neutraliseerida kemikaalide või bioloogiliste materjalidega, mis võivad aidata neid lagundada.
Enamikul riikidel on ranged valitsuse eeskirjad, mis määravad jäätmete käitlemise. Majaomanikud, kellel on ohtlikke jäätmeid, nagu vanad akud, majapidamises kasutatavad puhastusvahendid või autovedelikud, ei tohiks proovida neid esemeid ise ära visata. Neid tuleks hoida lekkekindlates konteinerites ja viia lähimasse rajatisse, kus neid korralikult töödeldakse või hoitakse. Need rajatised leiate keskkonnaagentuuride või nende kaupade tootjate poole pöördudes.