Mittetulundusühingute rahastamine võib tulla mitmest kohast. Toetused ja lepingud annavad sageli suure osa organisatsiooni rahalistest vahenditest. Klienditasud ja äritegevused võimaldavad organisatsioonidel teenida ka programmide rahastamist.
Sihtasutuse ja sihtfinantseeringud annavad sageli olulise osa mittetulundusühingute rahastamisest. Agentuurid koostavad sageli toetusettepanekuid uue programmi elluviimisel, et taotleda valitsuselt või sihtasutuselt rahalist abi. Toetuse määramise korral saab organisatsioon rahasumma, mida kulutatakse konkreetsetel eesmärkidel vastavalt ettepanekule ja rahastamisallikas sätestatud tingimustele. Toetuse pikendamine võib olla saadaval siis, kui esialgsed vahendid on kulutatud.
Lepingud, eriti riigilepingud, on mittetulundusühingute tavaline rahastamisallikas. Kui mittetulundusühing pakub teenust, mis võib olla kasulik teistele organisatsioonidele (nt puuetega inimeste transport), võib agentuur saada teenuse osutamiseks lepingu riigilt või muult organisatsioonilt. Lepingus on üldjuhul sätestatud aja pikkus ja makseprotsess. Populaarsed lepingutüübid hõlmavad kulude hüvitamise, tulemuslikkuse ja juhitud hoolduslepinguid ning kasutatav tüüp määrab maksete arvutamise.
Vastupidiselt levinud arvamusele võib mittetulundusühing teenida kasumit seni, kuni ta kulutab raha oma klientidele teenuse osutamiseks. Klienditasude võtmine osutatud teenuste eest võib olla mittetulundusühingu peamiseks rahastamisallikaks. Pole harvad juhud, kui klienditasud katavad programmi osalised või täielikud kulud. Mõnel juhul võivad populaarselt programmilt kogutud tasud pakkuda piisavalt vahendeid, et katta ka organisatsiooni teiste programmide kulud.
Lisaks klienditasudele rahastavad äriettevõtted mõnikord ka mittetulundusorganisatsioone. Mõned heategevusorganisatsioonid müüvad kaupu, et oma programmide jaoks raha teenida. Näiteks võib pensionäride kogukond müüa elanike loodud käsitööd. Maksuvaba mittetulundusliku staatuse kaotamise vältimiseks peab äriettevõte olema otseselt seotud organisatsiooni missiooniga ja ettevõte ei saa muutuda liiga suureks. Veebipoodide esiküljed on populaarsed müügikohad mittetulundusühingute äritegevuse jaoks, kuna nende rakendamine või hooldamine maksab vähe.
Heategevuslikud meeldetuletusfondid ja pärandusprogrammid pakuvad ka pikaajalist rahastamist mittetulundusühingutele. Heategevuslikes meeldetuletusfondides annavad annetajad organisatsioonile aktsiaid, võlakirju või sularaha, saades maksuvabastuse ja garanteeritud sissetuleku kogu eluks. Pärast annetaja surma saab organisatsioon ülejäänud usalduse. Samamoodi võimaldavad pärandusprogrammid inimestel jätta osa oma varast organisatsioonile. Annetajad kaasavad organisatsiooni sisuliselt oma testamenti ja organisatsioon saab annetuse kätte, kui annetaja sureb.