Mitme helikaardi süsteem arvutis võib anda arvuti helisüsteemile mitmekülgsuse ja juhtimise, kuid seda tüüpi seadistus võib põhjustada ka mõningaid probleeme. Suure võimsusega helikaardid võivad olla mahukad ja takistada muu riistvara või arvuti jahutamist. Mõnikord võib mitme helikaardi süsteem tavakasutajatele segadusse ajada, mistõttu ei pruugi see olla hea mõte kodudes, kus erinevate arvutioskustega kasutajad kasutavad ühte arvutit. Olenevalt heli käivitavast tarkvarast võivad mitu helikaarti muuta heliväljundallikate vahetamise keeruliseks või ebamugavaks.
Üheks positiivseks aspektiks mitme helikaardi seadistamisel on võimalus esitada korraga kahte helivoogu erinevatesse kõlaritesse. Tavaliselt saab seda teha ainult tarkvaraga, mis on loodud mitme helikaardi käivitamiseks tarkvara sees. Koduses arvutimeediumikeskuses võib mitme helikaardi süsteem tähendada, et üks inimene saab vaadata filmi kõrvaklappidest kõlava heliga, samal ajal kui keegi teine kuulab ruumis kõlaritest muusikat. Mitme monitoriga arvutite puhul võivad kaks heliväljundkanalit võimaldada kahel kasutajal korraga erinevaid filme vaadata.
Mitme helikaardi olemasolu arvutis on puuduseks helikaartide vahetamise protsess. Kui kasutaja kuulab heli läbi ühe helikaardi ja soovib kuulata heli läbi teise helikaardi, peab kasutaja paljudes tarkvarameediumiprogrammides programmi sulgema, muutma arvuti juhtpaneelil helikaardi väljundit ja taaskäivitama meediaprogramm. See on eriti levinud video või heli esitamisel veebibrauseri kaudu.
Mitme helikaardi teine puudus on see, et nende olemasolu võib arvutit tungleda või tööjaama segada. Lisaks sellele, et helikaardid ise võtavad ruumi, on igal heliüksusel kõrvaklapid või väljundkõlarid, mis võtavad ka ruumi. Professionaalsed heliinsenerid kasutavad mitme helikaardi salvestamise seadistusega ühendatud heliseadmete korrastamiseks sageli nagid või riiulid.
Igal mitme helikaardisüsteemi tüübil on oma ruumiprobleemid. Välised helikaardid võtavad lauaruumi ja neil on kohmakad juhtmed, mis võivad tööjaama segada. Sisemiselt paigaldatud helikaardid võtavad ruumi ja toodavad soojust, mistõttu on suurem tõenäosus, et arvuti kuumeneb. Selle probleemi lahendamiseks valivad mõned kasutajad suurema ja mahukama arvutikorpuse, samas kui mõned võivad paigaldada täiustatud jahutussüsteemi, et korpusest soojust paremini eemaldada.
Mõnel juhul on mitme helikaardi seadistamine vältimatu. Mõnel arvutil on arvuti emaplaadile sisseehitatud helikaart. Emaplaat on arvuti peamine kiibistik, mis sisaldab protsessori kiipi. Kui kasutaja uuendab sisseehitatud emaplaadipõhiselt helikaardilt teises pesas installitud helikaardile, ei saa ta tavaliselt algset helikaarti eemaldada, kuna see on osa arvuti olulisest riistvarast.