Kõige levinumad menstruatsiooni või amenorröa puudumise põhjused ilmnevad enne, kui noorel naisel on esimene menstruatsioon (menarhe) või pärast seda, kui ta on läbinud loomuliku või kirurgilise menopausi. Pärast menarhe ja enne menopausi võib amenorröa põhjustada veel üks tavaline elumuutus: rasedus. Kui need kolm kõige levinumat põhjust välja jätta, on amenorröa muud põhjused järgmised: ekstreemne treening või kehakaalu langus, tugev stress või depressioon, kilpnäärmehaigused, polütsüstiliste munasarjade sündroom, hormonaalsed rasestumisvastased tabletid ja muud ravimid.
Amenorröa on määratletud kui igakuise perioodi puudumine ja tavaliselt määratakse see ainult siis, kui menstruatsioonid on puudunud mitu kuud. Üksik menstruatsiooni vahelejätmise või väga hilise perioodi episood ei kuulu tingimata amenorröa määratluse alla, kuigi see kogemus esineb enamikul naistel, sageli suure stressi või üleminekuperioodidel. Arvestades, et rasedus on amenorröa tavaline seletus, peaksid seksuaalselt aktiivsed naised menstruatsiooni puudumisel kontrollima, et rasedus ei ole põhjus.
Nagu öeldud, on menstruatsiooni puudumise kolm levinumat põhjust menstruatsioonieelne menstruatsioon, menopausi saavutamine või rasedus. Naised, kes imetavad ainult õe, ei pruugi kuu aega pärast rasedust olla menstruatsioonivabad. See varieerub ja mõned imetavad naised naasevad kiiresti igakuise tsükli juurde, samas kui teistel võib kuue kuu kuni aasta jooksul menstruatsiooni puududa. Uuesti rasestuda on võimalik ilma, et menstruatsioon enne taastuks, seega ei tohiks rinnaga toitmist pidada usaldusväärseks rasestumisvastaseks vahendiks.
On uuringuid, mis seovad ekstreemset tegevust, näiteks sportlaste tegevust kui menstruatsiooni puudumise võimalikku põhjust. Sportlikkusest, äärmuslikust dieedist või näljast tingitud väga madal keharasv võib põhjustada munasarjade ovulatsiooni katkemise. Naised on teatanud ka mitme kuu menstruatsiooni ärajäämisest stressi või raske depressiooni ajal.
Menstruaaltsüklit võivad häirida ka muud asjad. Ravimata hüpotüreoidism ei pruugi põhjustada menstruatsiooni, nagu ka healoomulised kasvajad hüpofüüsis. Hormonaalsed rasestumisvastased meetmed põhjustavad ka menstruatsiooni katkemist, kuigi võib siiski esineda igakuist “verejooksu”. Verejooks ei tähenda menstruatsiooni pärast ovulatsiooni ja seega ei ole see menstruatsioon.
Lisaks hormonaalsele rasestumisvastasele vahendile on erinevaid ravimeid, mis võivad munasarjade funktsiooni kahjustada. Nende hulka kuuluvad mõned psühhiaatrilised ravimid, mõned steroidid ja paljud keemiaravimid. Ükskõik milline neist võib lühiajaliselt või pikka aega põhjustada menstruatsiooni. Munasarjade eemaldamine mis tahes põhjusel, polütsüstiliste munasarjade sündroomist tingitud düsfunktsioon või kaasasündinud munasarjade puudumine võivad olla võimalikud seletused, miks menstruatsiooni ei toimu.
Kuna enamikul juhtudel on igakuine menstruatsioon tavaline, väärivad üle kuu kestvad menstruatsiooni puudumise episoodid selgitust. Naistel soovitatakse menstruatsiooni lakkamisel abi otsida arstilt, eelistatavalt günekoloogilt.