Mammogrammikiirguse eeliste ja riskide kaalumisel on teadlased avastanud, et väikese doosiga kiirgus võib olla üsna kahjulik noortele naistele, kellel on geneetiline eelsoodumus rinnavähi tekkeks. Nende naiste puhul soovitavad eksperdid vältida mammograafiakiirgust ja kasutada alternatiivseid vähi tuvastamise meetodeid. Igas vanuses naistel võivad korduvad röntgenikiirguse riskid põhjustada ka vähi teket rinnakoes ja mõned eksperdid usuvad, et see võib kaasa aidata ka südamehaiguste tekkele. Enamiku naiste jaoks nõustuvad eksperdid, et perioodiline mammograafia on väga madala riskiga ohutu protseduur.
Mammogrammikiirgus võib põhjustada pöördumatuid kahjustusi spetsiifilistele DNA-rakkudele, nagu rinnakoe rakud, mis on identifitseeritud BRCA1- JA BRCA2-rakkudena. Need muteerunud rakud ei taastu kiirguskahjustusest ja seetõttu suurendavad nende mutatsioonidega naised rinnavähi riski. Arstid usuvad, et nende rinnarakkude mutatsioonidega 25-aastased ja nooremad naised saavad rohkem kasu, kui nad üritavad vähki avastada kiirgusvaba magnetresonantstomograafia (MRI) või ultraheliprotseduuride abil.
Mõned eksperdid on teatanud, et mammogrammi kiirgusega kokkupuude on väga madal. Teised aga väidavad, et mammogrammi kiirgustase ületab rutiinse rindkere röntgenülesvõttega saadava kiirguse kogust kuni 150 korda. Kui igale rinnale tehakse vähemalt kaks röntgenikiirgust, tehakse enamiku mammograafiauuringute puhul kokku neli röntgenikiirgust. Nende koguste pärast mures olevad arstid väidavad, et sellist asja nagu ohutu kiirgustase ei ole olemas ja et isegi väikseimad doosid võivad põhjustada geenimutatsioone, mis võivad põhjustada vähirakkude arengut.
Lisaks rinnavähi tekkele väidavad mõned eksperdid, et kiiritus võib kaasa aidata ka vähi tekkele teistes kehaosades ja südamehaiguste tekkele. See on eriti murettekitav mammograafiaga patsientide puhul, kellele on hiljuti tehtud ka muid uuringuid, sealhulgas hambaarsti ja rindkere uuringuid. Nendel isikutel suurendab mammograafiakiirgus ainult üldist kokkupuute taset ja võib põhjustada korvamatut rakukahjustust.
Eksperdid soovitavad naistel arutada oma arstiga hiljutisi kokkupuuteid kiirgusega, enne kui nad nõustuvad mammograafiakiirgusega. See võib vähendada rakukahjustuse ohtu. Kuigi mammogrammkiirgus kujutab endast tõsist vähiriski noortele naistele, kellel on geneetiline rinnavähk, on enamik uuringuid järeldanud, et risk tervetel üle 35- või 40-aastastel naistel on minimaalne, kuigi kiirgusega kaasneb alati ka rakukahjustuse võimalus, isegi kui väikesed tasemed.