Madala süsivesikusisaldusega muffineid saab valmistada mitmesugustest koostisosadest ja maitseainetest, sealhulgas puuviljadest. Mustikad, banaanid ja jõhvikad võivad vähese süsivesikusisaldusega muffinitele maitset anda. Muud muffini koostisosade valikud hõlmavad mitmesuguseid köögivilju, nagu suvikõrvits, kõrvits ja spinat. Muffinite valmistamisel võib kasutada ka liha ja mereande, näiteks vorsti ja tuunikala. Munad on looduslikult madala süsivesikusisaldusega toiduained ja neid leidub paljudes madala süsivesikusisaldusega muffinite retseptides, sealhulgas šokolaadi-sojaja vähese süsivesikusisaldusega muffinites.
Paljudes madala süsivesikusisaldusega muffiniretseptides kasutatakse maitse andmiseks erinevat tüüpi puuvilju. Mustikamuffineid saab valmistada madala süsivesikusisaldusega, kasutades sojajahu, koort ja suhkruasendajat. Lisaks mustikatele võivad vähese süsivesikusisaldusega muffinites olla ka murakad, vaarikad ja jõhvikad. Mustikakliimuffineid saab valmistada, lisades segule nisukliisid. Madala süsivesikusisaldusega banaanimuffinid sisaldavad linaseemnejahu, majoneesi ja madala rasvasisaldusega banaanisiirupit.
Teiste magustoidu stiilis madala süsivesikusisaldusega muffinite hulka kuuluvad šokolaadi-sojast madala süsivesikusisaldusega muffinid. Nendes on sojajahu, munad ja kodujuust. Need on maitsestatud magustamata kakao, vaniljeekstrakti ja suhkruasendajaga. Madala süsivesikute sisaldusega suhkruvaba toorjuustukuffinid sisaldavad toorjuustu, suhkruasendajat ja mune. Madala süsivesikusisaldusega sõõrikumuffinid on valmistatud linaseemnest, mandlijahust ja sulatatud õllest. Neil on ka pett, suhkruasendaja ja kaneel.
Köögivilju saab kasutada paljudes madala süsivesikusisaldusega muffinites, sealhulgas madala süsivesikute sisaldusega suvikõrvitsamuffinites. Nahk jäetakse suvikõrvitsale, mis enne taignasse lisamist lõigatakse väikesteks kuubikuteks. Madala süsivesikusisaldusega kõrvitsamuffinid sisaldavad kõrvitsat, pipart ja jahvatatud nelki. Nende hulka kuuluvad ka mandlipiim, suhkruasendaja ja munad. Taimsed frittata muffinid sisaldavad erinevaid köögivilju, sealhulgas porrulauku, suvikõrvitsat ja spinatit. Neid valmistatakse ka fetajuustu, madala rasvasisaldusega hapukoore ja munadega.
Madala süsivesikusisaldusega muffinites võib olla liha ja kala. Madala süsivesikusisaldusega tuunikala muffinite valmistamisel kasutatakse tuunikala, sellerit ja sibulat. Neil on ka hakitud roheline paprika, Cheddari juust ja maitseained. Madala süsivesikusisaldusega munamuffinid ei sisalda leiba. Nende valmistamiseks surutakse lahtiselt vorsti muffinivormi pokaalide põhja ja külgedele ning küpsetatakse; seejärel pannakse muffinitopsi muna ja asetatakse tagasi ahju. Küpsetamise lõppedes on muffinid kaetud Ameerika juustuga.
Paljud vähese süsivesikusisaldusega muffinid sisaldavad ka pähkleid. Vähese süsivesikusisaldusega makadaamiapähkli- ja banaanimuffinid on valmistatud soja neljast, raskest koorest ja banaaniekstraktist. Retsept sisaldab ka nisukliisid, soodat ja jämedalt hakitud makadaamiapähkleid. Linamuffinid sisaldavad jahvatatud linaseemneid, vadakuvalgupulbrit ja hakitud pähkleid.