Madala süsivesikusisaldusega dieedi kõrvalmõjud on peamiselt seotud ainevahetusega ja otsese füüsilise reaktsiooniga tarbitavatele toiduainetele. Liigne gaas ja kõhukinnisus on kaks kõige levinumat probleemi, mis seda tüüpi dieediga on seotud. Tihti ammutab süsivesikutevaene dieet toiduenergiat valgusisalduse suurenemisest, mida võib kehas olla ka üleliigselt. Sellist dieeti nimetatakse sageli ketogeenseks, kuna ebapiisav süsivesikute sisaldus võib põhjustada ketoosi, seisundit, mille puhul inimene kaotab ebatervislikul hulgal vett ja naatriumi.
Teised madala süsivesikusisaldusega dieedi sagedased kõrvalnähud on ebaloomulik lihasnõrkus või krambid ja peavalud. Mõned patsiendid teatavad ka halvast hingeõhust ja seletamatust lööbest. Need sümptomid võivad olla tingitud süsivesikute ja suhkru puudusest, mida organism vajab energia tootmiseks ja toidu õigeks töötlemiseks.
Ketogeenne dieet on režiim, mille puhul süsivesikute tarbimine ei ole hea tervise säilitamiseks piisav. See põhjustab ketoosi, seisundit, kus ketokehade liig takistab keha võimet töödelda glükoosi, mis on peamine energiaallikas. Ketoonkehad arenevad energia saamiseks rasvhapete lagunemise tulemusena. Kui ketoone on liiga palju, on rasvade ainevahetus häiritud ja keha hakkab väljutama liigset soola ja vett. See võib sageli põhjustada nende elementide puudust.
Lihased ja maks talletavad süsivesikutest saadavat energiat. Kuna need varud võivad kesta üsna kaua, võivad vähese süsivesikusisaldusega dieedi kõrvalmõjud veidi aega võtta. Siiski on võimalik, et süsivesikuvaese dieedi varases staadiumis võib keha talitlushäireid tekkida, olenevalt inimese tervisest ja dieedi äärmuslikkusest.
On mitmeid kaalulangetusdieete, mis keskenduvad madala süsivesikusisaldusega režiimile. Paljud neist dieetidest keskenduvad valgurikkale toidule, mis sisaldab palju köögivilju. Üks kuulsamaid neist on Atkinsi dieet, mis oli 1990ndatel oma populaarsuse tipus. Paljud arstid on seda hiljem diskrediteerinud, kuna dieet aitab küll kaalu langetada, kuid valgurikas ja rasvane toit, mida see soodustab, kipub ohustama dieedipidaja üldist tervist.
Vaatamata madala süsivesikusisaldusega dieedi paljudele võimalikele negatiivsetele kõrvalmõjudele on selline režiim ette nähtud mitmete tingimuste korral. Seda kasutatakse tavaliselt diabeedi, epilepsia ja rasvumise raviks. Mõned arstid võivad seda soovitada ka polütsüstiliste munasarjade sündroomi või kroonilise väsimuse sündroomiga patsientidele.