Südamekahina põhjused jagunevad kahte tüüpi: “süütud” ja “ebanormaalsed”. Tavalised süütud südamekahinad on füüsiline kurnatus, palavik ja hormonaalsed häired. Ebanormaalsed südamekahina põhjused on seevastu oluliselt tõsisemad ja neile tuleks osutada arstiabi. Kaasasündinud südamerikked, infektsioonid ja südameklappide paksenemine on ühed levinumad ebanormaalsed põhjused.
Kui põhjus on süütu, ei kujuta südamekahin tervisele ohtu ja kipub aja jooksul kaduma. Süütu südamekahina korral on tekkiv müra tervet südant läbivast verest ilma kaasnevate sümptomite või südamehaigusele viitavate tunnusteta. Lisahelid on füüsilise tegevuse või palaviku loomulik tagajärg. Mõnel juhul võivad aneemia ja hüpertüreoidism põhjustada südamekahinat. Rasedus võib vallandada ka turbulentse verevoolu, kuna keha loob loote toitmiseks rohkem verd.
Süütu südamekahin ei põhjusta inimese üldisele heaolule häireid ja tavaliselt kaob aja jooksul. Tervetel lastel on südamekahinad kergesti tuvastatavad, kuna südame ja stetoskoobi vahel on vähem füüsilist kudet, mis võib teadmata vanemates ärevust tekitada. Laste vanemaks saades muutub müra kuuldavamaks.
Ebanormaalsete südamekahinate põhjuste hulka kuuluvad omandatud südameklapi haigus ja kaasasündinud südamehaigus. Südameklapi haigus on üks kõige sagedamini teatatud südamekahinate põhjustest täiskasvanutel. Tavaliselt on see seotud seisundi tagajärg, mis hävitab klapid, näiteks südamekahjustuse, kõrge vererõhu või ateroskleroosi armkude. Ravimata streptokokkinfektsioonist tingitud reumaatiline palavik võib kahjustada ka südameklappi. Täiskasvanud, kellel on varem tekkinud südameklapi haigus, on haavatavad bakteriaalse infektsiooni suhtes, mida nimetatakse infektsioosseks endokardiidiks, mis moodustab klapi pinnale verehüübed ja muudab südamekahinad selgemaks.
Lastel on kõige sagedasemateks ebanormaalsete südamekahinate põhjusteks kaasasündinud südamerikked, sünnieelse arengu vigadest tulenevad deformatsioonid südame struktuuris. Need struktuursed defektid hõlmavad sageli südame siseseinu, klappe ning artereid ja veene, mis pumpavad verd kogu kehas. Paljud kaasasündinud defektid on lihtsad ega kujuta endast tõsist ohtu; paljud selle probleemiga sündinud lapsed elavad jätkuvalt tervet ja produktiivset elu. Mõned juhtumid võivad aga kujutada tõsist ohtu patsiendi tervisele ja vajada arstiabi varsti pärast sündi. Olenevalt kahjustuse tõsidusest vajavad paljud keeruliste kaasasündinud südameprobleemidega imikud kogu ülejäänud elu erilist hoolt.