Interneti-jaemüüjad seisavad silmitsi mitmete oluliste probleemidega, sealhulgas paljude samade probleemidega, mis enamikul ettevõtetel, nagu juriidilised, finants- ja praktilised tõkked. Samuti on mitmeid konkreetseid e-kaubandusega seotud probleeme, mis on unikaalsed Interneti-jaemüüjatele.
Turvalisus on kõigist e-kaubanduse probleemidest vaieldamatult kõige olulisem. Igal veebisaidil, mis aktsepteerib veebimakseid, on nii moraalne kui ka juriidiline kohustus teha kõik endast oleneva, et tagada oma kliendi kaardiandmete kaitsmine. Väiksematel ettevõtetel võib olla lihtsam kasutada välist maksekäsitlussüsteemi. See tähendab, et „väljamakse“ makseetapis suunatakse klient ümber sõltumatusse firmasse, kes kontrollib tema kaardiandmeid ja võtab vastu makse. See maksab jaemüüjale tasu, tavaliselt vahendustasu, mis põhineb müügihinnal, kuid võib säästa stressi ja tüli.
Samamoodi peavad veebimüüjad olema eriti ettevaatlikud, et vältida nende saidi nakatumist viiruste ja muu pahatahtliku tarkvaraga. Kuigi see ei ole tingimata jaemüüja süü, võib klientide arvuteid kahjustav sait kliendisuhetele laastavalt mõjuda. Üks punkt, mis on eriti ohtlik, on see, kui sait kannab väliseid reklaame ja sidusettevõtete linke, mis võivad nakkusi kanda.
Kohaletoimetamine on veel üks oluline küsimus. Kui Interneti-jaemüüja valib ebausaldusväärse tarneviisi, vastutab klient tõenäoliselt mitte tarneettevõtte eest. Jaemüüjad peavad otsustama ka kohaletoimetamistasu poliitika üle, mis võib hõlmata tasuta kohaletoimetamist, kindla tasu võtmist, kaalu järgi võtmist või kliendilt tarneettevõttele makstud tegeliku tasu võtmist.
Üks vähemtuntud e-kaubanduse probleeme on saidi puuetega külastajad. Olenevalt jaemüüja asukohast võivad nende suhtes kehtida puuetega inimeste diskrimineerimist käsitlevad seadused; see on palju tõenäolisem pood, mitte puhtalt teabepõhise saidi puhul. Saidi võimalikult juurdepääsetavaks muutmine on nii viisakuse kui ka ärilise mõttekuse küsimus. See hõlmab selle tagamist, et saiti saab juurdepääsetavustehnoloogia abil kohandada. Samuti on oluline, et fotodele ja graafilisele tekstile, näiteks Flash-animatsioonidele, oleks alternatiivsed tekstid, et sisu saaks nägemispuudega kasutajatele ekraanilugeja tehnoloogia abil hallata.
Paljud e-kaubandusega seotud probleemid tulenevad asjaolust, et Interneti-jaemüüjad müüvad kaupu osariigi ja isegi rahvusvaheliste liinide vahel. See võib tekitada keerulisi olukordi maksude ja lõivude sissenõudmisel ja jagamisel nii jaemüüja kui ka müüja jurisdiktsioonis. Võib esineda ekspordipiiranguid, mis takistavad või piiravad Interneti-jaemüüjal kaupade tarnimist välisklientidele. Mõne toote puhul võib klientide minimaalne vanus osariigiti ja riigiti erineda.
SmartAsset.