Kognitiivseid puudujääke, ajufunktsiooni variatsioone, mis põhjustavad raskusi kognitiivsete ülesannete täitmisel, on väga erinevaid. Need võib laias laastus jagada üldisteks ja spetsiifilisteks puudusteks, olenevalt sellest, kas need hõlmavad probleeme üldise funktsioneerimisega, nagu on näha vaimse alaarengu puhul, või raskusi teatud tüüpi kognitiivsete ülesannetega, nagu keele omandamine. Kognitiivse puudulikkuse ravi varieerub sõltuvalt nende põhjusest ja raskusastmest ning võib hõlmata ravimeid, ravi ja toetavat ravi.
Põhjuseid, miks ajufunktsioon võib muutuda, on mitmeid. Mõnedel inimestel on kaasasündinud kognitiivsed häired, mis on põhjustatud loote arengu muutustest, geneetilistest häiretest või sündides tekkinud ajukahjustusest. Teistel inimestel tekivad defitsiit progresseeruvate neuroloogiliste haiguste, peavigastuste ja uimastitarbimise tagajärjel. Mõnikord on need puudujäägid olemuselt iatrogeensed ja põhjustatud meditsiinilisest ravist. Teatakse, et mõned ravimid mõjutavad näiteks kognitiivset funktsiooni.
Üldise kognitiivse puudulikkuse korral kogevad patsiendid kognitiivse funktsiooni üldist vähenemist. Neil on raskusi paljude ülesannete täitmisega ja nad ei pruugi olla võimelised iseseisvalt töötama. Neuroloogilised häired, eriti kaugelearenenud staadiumis, võivad põhjustada sellist kahjustust, nagu ka mõned kaasasündinud seisundid. Näiteks Downi sündroomiga seotud intellektipuudega lastel on üldine kognitiivne defitsiit. Mõned vaimuhaigused võivad põhjustada ka seda tüüpi puudujääke, häirides ajufunktsiooni ja mõnel juhul põhjustavad vaimuhaiguste raviks kasutatavad ravimid ajufunktsiooni häireid.
Konkreetsete puudujääkide korral võivad inimesed mõnes valdkonnas hästi toimida, mõnes mitte. Düsleksia, õpiraskused nagu ADHD ja kuulmistöötlushäired on mõned näited konkreetsetest kognitiivsetest puudujääkidest. Nendel patsientidel on üldine ajufunktsioon ootuspärane ja patsient suudab täita mitmesuguseid kognitiivseid ülesandeid, kuid tal on raskusi ülesannetega, mis nõuavad funktsiooni teatud ajupiirkondades. Need patsiendid võivad olla teatud tüüpi ülesannete täitmisel kõrgelt kvalifitseeritud ja neil võib mõnikord olla kõrge kohanemisvõime, et kompenseerida oma puudujääke.
Kui inimesed lähevad kognitiivsete häiretega arsti juurde, viiakse läbi põhjalik hindamine, et dokumenteerida probleemi ulatus ja saada rohkem teavet võimaliku põhjuse kohta. Seda teavet saab kasutada raviplaani koostamiseks. Patsiendi kohandamine on ravi tavaline komponent, kasutades selliseid asju nagu õpilase õppekava kohandamine, mille eesmärk on aidata õpilasel õppida. Mõnikord võivad ravimid aidata, eriti spetsiifiliste kognitiivsete häirete korral, nagu ka tegevusteraapia, mis aitab patsiendil eluoskusi arendada.