Glükoosamiinsulfaadi kõrvaltoimed on tavaliselt kerged, kuigi pärast selle ravimi võtmist tekkivatest häirivatest sümptomitest tuleb arstile edasiseks meditsiiniliseks hindamiseks teatada. Mõned kõige sagedamini teatatud kõrvaltoimed on iiveldus, kõhulahtisus või kõhukinnisus. Glükoosamiinsulfaadi täiendavad kõrvaltoimed võivad hõlmata peavalu, pearinglust või nahareaktsioone. Karpide suhtes allergilised või diabeediga inimesed peaksid seda ravimit kasutama ainult arsti otsese järelevalve all. Kõiki küsimusi või muresid glükoosamiinsulfaadi võimalike kõrvaltoimete kohta individuaalselt tuleb arutada arsti või muu meditsiinitöötajaga.
Seedetrakti häired on glükoosamiinsulfaadi kõige sagedasemad kõrvaltoimed. Seda tüüpi sümptomid võivad hõlmata iiveldust, oksendamist või kõhulahtisust. Mõnedel patsientidel võib tekkida kõhukinnisus või vaheldumisi kõhukinnisus ja kõhulahtisus. Samuti võivad tekkida kõrvetised, isutus või kõhuvalu. Mõnda neist kõrvaltoimetest saab minimeerida, kui võtta ravimit koos toidu või piimaga.
Glükoosamiinsulfaadi võtmisel võib tekkida unetus, peavalu või pearinglus. See ravim võib suurendada verejooksu riski, eriti neil, kellel on veritsushäired. Mõned ravimid või taimsed toidulisandid võivad neid riske suurendada, seetõttu tuleb enne kasutamist arstiga nõu pidada. Mõnedel glükoosamiinsulfaati kasutavatel inimestel võivad tekkida nahareaktsioonid, nagu lööve, sügelus või põletustunne. Kuigi need nahareaktsioonid on tavaliselt kerged, tuleb kõigist olulistest nahamuutustest teavitada arsti, et välistada võimalik allergiline reaktsioon.
Need, kes on karploomade suhtes allergilised, peaksid seda ravimit kasutama ainult arsti otsese järelevalve all. Glükoosamiinsulfaat on valmistatud krabide, homaaride või krevettide kestadest. Enamik inimesi, kellel on karploomade allergia, reageerib ainult nende olendite lihale, kuigi selle ravimi võtmisel on teatatud sarnastest reaktsioonidest.
Mõned glükoosamiinsulfaadi kõrvaltoimed võivad hõlmata veresuhkru muutusi või astma sümptomeid, nagu köha, vilistav hingamine või hingamisraskused. Diabeediga patsiendid peaksid enne selle ravimi kasutamist konsulteerima arstiga, kuna võib olla soovitatav teha sagedasemaid vereanalüüse. Astma või muude hingamisteede haigustega inimestel ei pruugita soovitada glükoosamiinsulfaati võtta.
Harvadel juhtudel võib glükoosamiinsulfaadi võtmisel tekkida raske ja potentsiaalselt eluohtlik allergiline reaktsioon, mida nimetatakse anafülaksiaks. Allergilise reaktsiooni sümptomiteks võivad olla näo turse, hingamisraskused ja valu rinnus. Neid sümptomeid tuleks käsitleda kui meditsiinilist hädaabi, sest ilma kohese arstiabita võib surm tekkida mõne minuti jooksul.