Fosfatidüülseriini kõrvaltoimed on tavaliselt suhteliselt kerged, kuni kasutaja võtab ravimit ohututes kogustes. Tavaliselt hõlmavad need ainult kerget ebamugavustunnet seedetraktis. Kui seda võetakse koos teiste ravimitega, eriti teatud tüüpi verevedeldajatega, võivad fosfatidüülseriini kõrvaltoimed hõlmata vere vedeldamist ebatervislikule tasemele. Veel üks probleem fosfatidüülseriini võtmisel on see, et teadlased ei ole täielikult kindlaks määranud ravimi ohutuid maksimaalseid annuseid lastele või eakatele, mistõttu peaksid nende rühmade patsiendid ravimit tarbima ainult väikestes kogustes.
Fosfatidüülseriin on kemikaal, mis kuulub keemiliste ühendite fosfolipiidide klassi. See on rakumembraani oluline osa ja inimkeha toodab seda väikestes kogustes ise. On tõendeid, mis viitavad sellele, et keha loomuliku fosfatidüülseriini taseme täiendamine võib viia vaimse funktsiooni paranemiseni. Selle tulemusena usuvad teadlased, et ravim võib aidata ravida teatud vaimuhaigusi, nagu Alzheimeri tõbi, depressioon ja tähelepanupuudulikkuse hüperaktiivsuse häire (ADHD).
Algselt kasutasid farmaatsiaettevõtted toidulisandite jaoks fosfatidüülseriini saamiseks lehma ajusid. Siiski on olnud muret, et see meetod võib põhjustada fosfatidüülseriini kõrvaltoimeid, mis hõlmavad kahjulike viiruste, näiteks hullu lehma tõve nakatumist. Fosfatidüülseriinid on saadud taimsetest ainetest, kuigi on tõendeid selle kohta, et toidulisand on vähem efektiivne, kui selle allikaks on köögiviljad.
Samuti on tõendeid selle kohta, et fosfatidüülseriin võib olla sportlastele kasulik. Aine võib treeningu ajal põhjustada kerget kortisooli vabanemise vähenemist kehas. Kortisool põhjustab lihaste lagunemist, mis võib piirata lihaste kasvu ja põhjustada valulikkust, lükates nii edasi tulevasi treeninguid. Kortisooli piiramine võib aidata sportlastel lihaseid kiiremini üles ehitada. Selle kasu saavutamiseks peab sportlane aga võtma suures koguses fosfatidüülseriini, mis omakorda põhjustab suuremal määral fosfatidüülseriini kõrvaltoimeid.
Fosfatidüülseriini kõrvaltoimed, mis tekitavad suurimat muret, on need, mis on seotud selle koostoimega erinevate verevedeldajatega. See probleem tekib kõige sagedamini siis, kui katsealused võtavad ginkot. Ginko, nagu fosfatidüülseriin, aitab kaasa vaimsele funktsioonile, mistõttu pole harvad juhud, kui katsealused võtavad mõlemat ravimit. Ginko on siiski verd vedeldaja ja tõendid näitavad, et fosfatidüülseriin võib suurendada ginko hõrenemist, võib-olla kahjuliku tasemeni. See võib kehtida ka siis, kui katsealused võtavad fosfatidüülseriini koos teiste verd vedeldavate ravimitega, nagu varfariin, aspiriin, pentoksüfülliin, klopidogreel, tiklopidiin, küüslauk ja E-vitamiin.