Kurgus või neelus on igal ajahetkel suur hulk baktereid. Normaalse kurgufloora, enamiku tervete inimeste bakterite tuvastamiseks on läbi viidud mitmeid uuringuid. Mõned kurgus elavad bakterid võivad põhjustada haigusi, kui peremeesorganism on stressis, samas kui teistel on peremeesorganismi tervises neutraalne või isegi kasulik roll. Oma spetsiifiliste kurgubakterite kohta lisateabe saamiseks võivad inimesed teha bakterikultuuri, mille käigus võetakse kurgust tampooniproov ja kultiveeritakse, et näha, mis kasvab.
Igal ajahetkel võib paljude inimeste kurgus leida baktereid perekondadest Mycoplasma, Mycobacteria, Neisseria, Streptococcus, Corynebacteria, Lactobacillus ja Proteus. Levinud on ka klassidesse Spirochaetes ja Actinomycetes kuuluvad bakterid, samuti organismid Haemophilus influenze ja Pesudomonas aeruginosa. Normaalne bakterite tasakaal aitab kaasa seedesüsteemi tööle ning tõrjub ka kurku tungida võivaid halbu baktereid.
Lugejad võivad ära tunda mõne normaalse kurgu taimestiku nimed. Streptococcus on bakterite perekond, mis on seotud streptokokkidega, kurgupõletikuga, mis on põhjustatud koloniseerimisest Streptococcus A-rühma bakteritega. Neisseria, teine kõri elanik, võib põhjustada meningiiti Neisseria meningitidis’e infektsiooni kujul ja Corynebacterium diphtheriae põhjustab difteeria. Nende organismide olemasolu kurgus ei tähenda tingimata haigestumist, välja arvatud juhul, kui peremeesorganismis on stress või halb tervis, mis annab bakteritele avanemise.
Enamikku kurguvalu ja kurgupõletikke ei põhjusta tegelikult mitte bakterid, vaid viirused või seened. Soor on infektsioon, mis on põhjustatud pärmseene Candida albicans’iga koloniseerimisest. Kui bakterite tasakaal väljub kontrolli alt ja üks tüüp hakkab liiga kiiresti kasvama, võivad inimesed kogeda kurguvalu ja mitmesuguseid muid sümptomeid. Saab teha kurgukülvi, et näha, milline organism vastutab, ning määrata normaalse tasakaalu taastamiseks antibiootikumid.
Pikaajalise antibiootikumide kasutamise uuringud on näidanud, et inimesed võivad häirida suu ja kurgu baktereid, kui nad võtavad antibiootikume pikema aja jooksul. See võib omakorda muuta inimesed vastuvõtlikuks sellistele asjadele nagu pärmseente infektsioonid, sest bakterite konkurents ressursside pärast kaob. See on üks põhjus, miks meditsiinitöötajad püüavad antibiootikumide väljakirjutamisel olla ettevaatlikud ja tagada, et patsiendid kasutaksid antibiootikume vastavalt ettekirjutusele, et vältida pikaajalisi terviseprobleeme.