Juustukoogibatoone saab valmistada mitmel viisil, tavaliselt puuviljakattega või ilma puuvilju lisamata. Traditsioonilises stiilis juustukoogibatoonide alternatiivid hõlmavad madala rasvasisaldusega ja gluteenivabasid sorte. Madala rasvasisaldusega juustukoogibatoonid on valmistatud madala rasvasisaldusega toorjuustuga, et saada vähem kaloreid ja vähem rasva. Lisaks on erinevaid juustukookide stiile, näiteks New Yorgi stiilis ja prantsuse stiilis. Juustukoogid sisaldavad traditsioonilisi küpsetatud sorte ja küpsetamiseta retsepte.
Gluteenivaba juustukook valmistatakse ilma nisujahuta ja tüüpilise Grahami kreekerikoore võib asendada pähklikoorega. Gluteenivaba juustukoogi batooni koore valmistamiseks võib lisaks gluteenivabale jahule kasutada ka hakitud pähkleid. Muud gluteenivaba juustukoogi kooriku valmistamiseks kasutatavad koostisosad võivad sisaldada pruuni suhkrut ja võid või margariini. Seda juustukooki valmistatakse tavaliselt tavalise või madala rasvasisaldusega toorjuustu, munade, suhkru ja soovi korral näpuotsaga vaniljega.
Mugavuse huvides võib juustukooke valmistada ilma küpsetamiseta retsepti järgi. Küpsetusvabade batoonide koostisosad võivad olla omatehtud või poest ostetud segu. Pärast seda, kui juustukoogi koostisosad on koorikusse valatud, hoitakse segu külmkapis mitu tundi või kuni see on tahke. Kui juustukook on kõva, võib selle lõigata kangideks või ruutudeks.
Piimavabad juustukoogibatoonid on hea alternatiiv neile, kes ei talu laktoosi. Soja-toorjuustu võib asendada tavalise piimatoorjuustuga. Sojast valmistatud piimavaba juustukoogi tekstuur ja maitse erineb mõnevõrra traditsioonilisest retseptist. Soja-toorjuustu müüakse tavaliselt vannides või baarides ning seda tuleb enne retsepti valmistamist pehmendada.
Olenemata sellest, kas kasutate madala rasvasisaldusega, gluteenivaba või piimavaba retsepti, on juustukoogibatoone erineva maitsega. Kõrvitsa-juustukook on sügisel populaarne valik. Seda maitsvat juustukooki saab valmistada konserveeritud kõrvitsa, kaneeli ja pipraga.
Puuviljamaitseliste juustukoogibatoonide jaoks võib kasutada puuviljapirukate täidist. Teise võimalusena võib batoonidele enne või pärast küpsetamist lisada värskeid puuvilju. Kirss, maasikas ja ananass on populaarsed juustukoogid. Magusaks vahelduseks võib šokolaaditükkidega juustukoogibatoone valmistada poolmagusate või piima-šokolaaditükkidega.
Mõned inimesed eelistavad segamarjajuustukoogi batooni. Segamarjajuustukooki võib valmistada külmutatud segamarjadest, mis on sulatatud. Teise võimalusena võib selle juustukoogi retsepti jaoks kasutada muraka- ja vaarikakonserve. Lisaks lisab marjasegujogurt juustukoogibatoonidele kreemjat tekstuuri.