Meditsiinitöötajad kasutavad endoskoopiaseadmeid kehaõõne või elundi sisemuse vaatamiseks endoskoobiks nimetatava tööriista abil, mis sisestatakse läbi loomuliku avause või väikese kirurgilise avause. Neid meditsiinilisi pildistamisseadmeid kasutatakse diagnostiliselt, operatsioonide ajal ja anatoomiakursuste täiustamise vahendina. Endoskoopiaseadmete kaks peamist kategooriat on jäigad ja painduvad endoskoobid. Vaadatavate kehaosade jaoks on nimetatud spetsiifilised endoskoobid. Käärsoole vaatamiseks kasutatakse kolonoskoopi, söögitoru vaatamiseks esofagoskoopi ja liigese sisemuse vaatamiseks antroskoopi.
Jäigad endoskoobid pakuvad parima eraldusvõimega pilte. Need on valmistatud tahkest metalltorust, kasutades pildistamiseks läätsi ja valgustamiseks fiiberoptilisi materjale. Jäigad endoskoobid ei paindu ja neid kasutatakse jäiga seadmega ligipääsetavate kehaosade vaatamiseks. Seda tüüpi endoskoopiaseadmeid kasutatakse liigeste, mõnede naiste suguelundite ning kõrva, nina ja kõri vaatamiseks. Kolonoskoobid on veel üks näide seda tüüpi endoskoopiaseadmetest.
Paindlikud endoskoobid võimaldavad vaadata keha sisemisi osi, millele jäiga endoskoobiga ligi ei pääse. Klaasist või plastist kiukimpe kasutav fiiberoptika asendab läätsesid. Optiline selgus ja eraldusvõime sõltuvad kasutatava kiu tüübist; parima kvaliteediga pildid tagavad üldiselt sulatatud kvartskiud. Painduva endoskoobi näide on bronhoskoobid, mida kasutatakse hingetoru ja bronhide sisemuse vaatamiseks.
Laparoskoopid on teatud tüüpi endoskoopiaseadmed, mida kasutatakse peamiselt kõhuõõneoperatsioonide ajal. Laparoskoopide kasutamine on muutnud paljud kirurgilised protseduurid vähem invasiivseks. Seda tööriista ei kasutata mitte ainult elundite valgustamiseks ja vaatamiseks, vaid see võib olla varustatud ka operatsiooni abistavate tööriistadega. Üks mao suuruse vähendamise operatsioon kasutab laparoskoopi, et asetada riba ümber mao osa. Tsüstoskoop on laparoskoopiga sarnane kirurgilise endoskoopia tööriist, mida kasutatakse põie polüüpide eemaldamiseks kuseteede kaudu.
Kapsli endoskoopias kasutatakse pisikest kaamerat, mis asetatakse kapslisse, mis ei ole suurem kui pill. Patsient neelab selle alla ja miniatuurne kaamera salvestab pilte seedetraktist, mida ei saa teiste endoskoopiaseadmetega kätte. Kapslit saab juhtida juhtkangi ja magnetväljaga, samal ajal kui see juhtmevabalt pilte edastab. Seda tüüpi endoskoopiat tehakse peamiselt peensoole, mao ja käärsoole vahelise seedetrakti piirkonna vaatamiseks, mis on ülemise endoskoopia või kolonoskoobiga ligipääsmatu.
Kõik meditsiiniliseks kasutamiseks mõeldud endoskoobid on steriliseerimise tagamiseks pitseeritud. Veterinaararstid kasutavad meditsiiniliste protseduuride jaoks endoskoopiaseadmeid samamoodi nagu arstid inimpatsientide puhul. Tööstuslikud endoskoobid ehk boroskoobid kasutavad samasugust tehnoloogiat kui meditsiinilised endoskoopiaseadmed, kuid neid ei toodeta steriliseerimisprotseduuridele vastu pidama. Laparoskoobi optika, valgustuse, kujutiste kuvamise ja muude funktsioonide areng jätkub, kuna diagnostika ja kirurgia mitteinvasiivsemad suundumused arenevad edasi.