Kliiniline farmaatsia on üldiselt dünaamiline valdkond, kus on palju erinevaid töövõimalusi. Näiteks kliinilise apteekri töökohad on saadaval paljudes seadetes. Sellised apteekrid võivad töötada haiglates, kliinikutes, apteekides, uurimislaborites ja akadeemilistes asutustes. Neilt võidakse nõuda ka paljude erinevate funktsioonide täitmist, näiteks retseptide jälgimist, ravimite valmistamist ja apteekrite praktikantide juhendamist. Läbivaks jooneks erinevate kliiniliste apteekrite ametikohtade vahel on üldine rõhuasetus patsiendihoolduse mõistele. See tähendab, et need spetsialistid töötavad selle nimel, et edendada ja tagada, et ravimeid kasutatakse ohutul ja tõhusal viisil.
Kliinilistel apteekritel on üldiselt põhjalik haridus. Sellisena on nad tavaliselt teeninud farmaatsiadoktori kraadi. Tavaliselt on nad hästi kursis sellistes valdkondades nagu farmaatsia, kliinilised teadused, käitumisteadused ja meditsiinieetika.
Üks peamisi erinevusi erinevate kliiniliste apteekrite töökohtade vahel on töökeskkond. Näiteks töötavad mõned apteekrid haiglatingimustes – manustavad patsientidele ravimeid, jälgides samal ajal ravimite efektiivsust ja veendudes, et saadav tervishoiuteenus on optimaalne. Seda tüüpi kliiniline apteeker teeb patsiendihoolduse maksimeerimiseks üldiselt tihedat koostööd arstide ja õdedega. Apteekrid võivad arstiga arutada patsiendi jaoks parimat võimalikku ravi. Seda tehes võib kliiniline apteeker aidata määrata õigeid annuseid ja teavitada töötajaid ravimiga seotud võimalikest kõrvaltoimetest.
Kliinikus töötaval apteekril on samad kohustused kui haiglas töötaval apteekril. Paljudel juhtudel on ta kohustatud andma meditsiinitöötajatele juhiseid või teavet uimastite kohta. See võib hõlmata üldist tutvustust erinevate turul olevate ravimite ning nende eeliste ja puudustega. Samuti võib ta õpetada personalile ravimite õiget kasutamist ja manustamist. See võib olla lisaks tema muudele kvaliteetse patsiendihoolduse tagamise kohustustele. Mõnikord teeb kliiniline apteeker ka ravimitellimusi rajatisele.
Mõned kliinilise apteekri töökohad hõlmavad mentor- või juhendamisrolli. Tavaliselt tähendab see, et need spetsialistid jälgivad noorte apteekrite praktikante mitmesuguste ülesannete täitmisel, näiteks ravimite ettevalmistamisel patsientidele kasutamiseks. Samuti võivad nad praktikante tutvustada saadaolevate erinevat tüüpi ravimitega. Kliinilised apteekrid võivad töötada ka eranditult akadeemilises rollis, esinedes konverentsidel ja kirjutades uurimistöid eelretsenseeritavatele teadusajakirjadele.