Inimese seedetraktis leidub mitut tüüpi baktereid. Mõned on seedebakterid, mis aitavad kaasa seedimisele ja aitavad tagada head tervist. Teist tüüpi bakterid võivad asuda seedetraktis ja põhjustada terviseprobleeme. Seedetraktis leiduvate bakteritüüpide hulgas on Lactobacillus, Bifidobacterium ja Escherichia.
Lactobacillus acidophilus on teatud tüüpi bakterid, mis elavad inimese peensooles. Seda peetakse kasulikuks bakteritüübiks mitmel põhjusel. See bakter sünteesib K-vitamiini ja on võimeline metaboliseerima laktoosi, mis on teatud tüüpi suhkrut, mida leidub piimatoodetes. Samuti toodab see aineid, mis takistavad kahjulike bakterite kasvu ja paljunemist seedetraktis. Kui inimese seedetraktis ei ole neid baktereid piisavalt, võib seedimine olla häiritud.
Sageli keskenduvad inimesed Lactobacillus acidophilus’e võimele kahjustada kahjulike bakterite kasvu. Kuid need seedebakterid aitavad kehal toota ka B-rühma vitamiine. Väidetavalt aitavad bakterid kolesterooli normaalsel tasemel hoida.
Bifidobacterium on teist tüüpi sõbralikud bakterid, mida leidub inimese seedetraktis. See elab inimese jämesooles ja mängib olulist rolli keha kaitsmisel teatud tüüpi pärmseente ja bakterite eest, mis on pigem kahjulikud kui kasulikud. See bakter võib häirida baktereid, mis põhjustavad soolestikku põletikku ja põhjustavad haigel kõhulahtisust. See pärsib bakterite kasvuvõimet. Samuti võib see aidata organismil toota B-vitamiini.
Streptococcus thermophilus on seedetrakti bakter, mis aitab organismil toota laktoosiensüüme. Need ensüümid on olulised piimatoodete seedimisel. See bakter aitab kaitsta ka inimese seedetrakti limaskesta, kui piim ja piimatooted läbivad seedimisprotsessi. Tegelikult väidetakse, et see bakter aitab inimestel vältida laktoositalumatuse ebameeldivaid sümptomeid.
Paljud inimesed on kuulnud Escherichia colist, mida tavaliselt nimetatakse E. coliks. Seda tüüpi bakterid on sageli süüdlased, kui kellelgi tekib seedehaigus, näiteks need, mis põhjustavad oksendamist ja kõhulahtisust. Escherichia coli on aga terve rühm baktereid ja mõned neist on sõbralikud. Mõned selle seedebakterite tüved aitavad organismil taimset toitu seedida. Mõned aitavad kehal toota ka K-vitamiini.