Habedraakonid on vastupidavad olendid, kes võivad elada 10 aastat või kauem, kuid nad on vastuvõtlikud haigustele. Levinud habedraakonihaiguste hulka kuuluvad metaboolne luuhaigus, stomatiit, hingamisteede infektsioon, lestad ja sabamädanik. Adenoviirus ja löök on samuti tavalised habedraakonihaigused. Habedraakonid on vastuvõtlikud ka teatud bakteriaalsetele ja seenhaigustele, mis on seotud sooja ja niiske keskkonnaga. Enamikul juhtudel on paljud levinud habedraakoni haigused ennetatavad ja ravitavad.
Metaboolne luuhaigus, üks levinumaid habedraakoni haigusi, on põhjustatud D3-vitamiini, kaltsiumi ja fosfori puudusest või tasakaalutusest. Kaltsiumipuudus draakoni kehas võib olla tingitud ebapiisavast kokkupuutest ultraviolettkiirgusega (UV) või kõrge fosfori- ja oksalaadisisaldusega toiduainete tarbimisest. Looma keha püüab kaltsiumipuudust kompenseerida luudest eraldades. Seejärel muutuvad luud nõrgaks ja rabedaks, mille tagajärjeks on luumurrud. Metaboolse luuhaiguse sümptomiteks on alalõua pehmenemine ja säärtel, sabal ja seljal tekkinud tükid.
Stomatiit, tuntud ka kui suumädanik, on infektsioon, mis on tavaliselt põhjustatud valest toitumisest ja parasiitide olemasolust. Selle sümptomiteks on isutus ja valkjas aine, mis katab suu pehmeid kudesid. Kui haigust ei ravita, võib see põhjustada igemete veritsemist ja hammaste väljalangemist.
Hingamisteede infektsioonile on iseloomulik vilistav hingamine, isutus, raske hingamine, kurgu pundumine ning lima eritumine ninast ja suust. Hingamisteede infektsioonid esinevad sageli lemmikloomade habemega draakonitel, keda peetakse halbades puuritingimustes. Pikaajaline kokkupuude madalate temperatuuride ja kõrge õhuniiskusega võib samuti põhjustada hingamisteede infektsiooni.
On siseparasiite, mis elavad keha sees, ja välisparasiite, mis elavad kehal ning mõlemad tüübid võivad habedraakoni tervist kahjustada. Parasiitide esinemine võib viidata valele toitumisele. Siseparasiidid võivad organismist toitaineid tühjendada, mille tagajärjeks on kaalulangus, kõhulahtisus ja isutus. Välised parasiidid, nagu puugid ja lestad, võivad haigusi edasi kanda ja immuunsüsteemi nõrgendada. Samuti võivad need põhjustada sügelust ja nahaärritust.
Habedraakonid võivad kannatada löökide all, kui nad tarbivad seedimatut toitu või materjali ja seedetrakt on blokeeritud. Seisund sarnaneb kõhukinnisusega, ainult hullem. Rasketel juhtudel võib see osutuda surmavaks, kui materjali eemaldamiseks ei tehta operatsiooni.
Adenoviirus on seedetrakti viiruslik põletik. Selle sümptomid on tavaliselt ebamäärased, kuid adenoviirusega habemega draakonil on tavaliselt isutus. Tõenäoliselt haigestuvad ühe kuni kolme kuu vanused habedraakonid.
Kuigi kollaseene mehaanika on endiselt ebaselge, arvatakse, et haigusseisundi põhjustab pärmseen, mis areneb pärast habedraakoni antibiootikumidega ravimist. Haigust iseloomustavad kollased seenhaigused nahal. Kollane seen on surmav, kui seda ei ravita.
Sabamädanikule on iseloomulik saba tumenemine, isutus ja letargia. Tavaliselt on see põhjustatud saba vigastusest. Sabamädanik võib tekkida ka siis, kui nahk ei tule maha, sest nahk võib koguneda ja verevoolu piirata. Lemmikloomaomanik saab seda haigusseisundit ära hoida, eemaldades lihtsalt kuurinaha ja kõik esemed, mis võivad põhjustada vigastusi.