Emaka või vaagnapiirkonna magnetresonantstomograafiat (MRI) tehakse sageli selliste seisundite diagnoosimiseks nagu fibroidid või endometrioos. Samuti võib teha emaka MRI, et teha kindlaks, kas munasarjade, emakakaela või emaka mass on healoomuline või vähkkasvaja. Emaka MRI võib teha ka siis, kui naisel on seletamatu viljatus või vaginaalne verejooks.
Mõnel juhul tehakse enne MRI-d emaka ultraheli. Ultraheli ei ole nii selge kui emaka MRI, seega ei saa see positiivselt diagnoosida selliseid haigusi nagu endometrioos. MRI abil saab kindlaks teha, kas naise emakas on massid, mis viitavad endometrioosile. Kui haigusseisundit kahtlustatakse, võib arst teha emaka sisemuse põhjalikumaks uurimiseks ja endometrioosi kinnitamiseks laparoskoopia.
Emaka MRI teine levinud põhjus on emakaverejooksu põhjuste diagnoosimine või fibroidide, emaka seinal kasvavate healoomuliste kasvajate tuvastamine. Kuigi paljudel juhtudel on fibroidid asümptomaatilised, võib mõnel naisel tekkida verejooks või väga rasked menstruatsioonid ning terav valu vaagnapiirkonnas. Olenevalt nende suurusest võivad need häirida ka naise rasestumist ja rasestumist.
Kuigi ultraheli võib olla fibroidide ja verejooksude diagnoosimiseks valitud pilt, võib emaka MRI anda selgemaid tulemusi. Tavaliselt eelistatakse ultraheliuuringuid, kuna need on odavamad kui MRI. MRI võib anda täpse pildi sellest, kus fibroidid emakas paiknevad ja kas need on hakanud lagunema, mis on sageli liigse verejooksu põhjuseks.
Emaka MRI-d saab kasutada ka teiste emaka masside täpsemaks tuvastamiseks kui ultraheli või muud pildid. Adenomüoosina tuntud seisundit, mille puhul endomeetriumi limaskest kasvab emaka lihaseinaks, on raske eristada fibroididest ainult ultraheliuuringuga. MRI-d kasutatakse sageli ka emakavähi diagnoosimiseks, millest kõige levinum on endomeetriumi vähk. Pildistamine võimaldab arstil näha, kui palju vähk on levinud, ja määrata vähi staadiumi.
Emaka MRI võib hinnata ka naise viljatuse põhjust. Mõnel juhul ei pruugi naise emakas olla korralikult moodustunud, mis võib põhjustada raskusi rasestumisel. Seletamatu viljakusega naine võib soovida teha MRT-uuringut, et arst saaks uurida tema emakat ja teha kindlaks, kas viljatuse põhjuseks on organi kõrvalekalle.