Nahkhiire guanoga seotud peamine terviseprobleem on histoplasmoos. See õhus leviv haigus pärineb seenest, mida leidub nahkhiirte väljaheidetes. See võib mõjutada iga inimese hingamisteid, kes hingavad sisse õhku, mis on sellega kokku puutunud. Keha on tavaliselt võimeline selle haigusega võitlema, kuid nõrgenenud immuunsüsteemiga inimesed võivad vajada raviks ravimeid.
Sageli valivad nahkhiired ööbimiseks kodude ja lautade pööningutel ning avatavad sarikad. Nad magavad päeval, peavad jahti öösiti ja võivad paaritumisel luua ulatuslikke pesasid ja mõne hooaja pärast poegi kandma. Nahkhiire guaano, mille nad maha jätavad, nii kodu ülaosas kui ka väljas maapinnal, on häirimisel inimestele väga mürgine.
Histoplasmoos võib elada nahkhiire guaano peal või pinnases, mis on kokku puutunud väljaheidetega. Kui guaanot mingil viisil segada, levib seene kiiresti õhus. See võib ringelda kodu või hoone hingavasse õhku ja nakatada iga inimese kopse, kes seda sisse hingab.
Haiguse idanemiseks ja sümptomite ilmnemiseks kulub tavaliselt umbes kümme päeva. Patsiendid kurdavad tavaliselt palavikku, valu rinnus, köha, peavalu ja isutus. Keha immuunsüsteem on üldiselt võimeline haigusega tõrjuma ja kogema täielikku taastumist mõne nädala jooksul. Inimesed, kellel on nõrgenenud immuunsüsteem, näiteks isikud, kes on juba mõnda teist haigust haiged või AIDS-i nakatunud, võivad vajada ravi, sealhulgas ravimeid ja haiglaravi.
Paljud riigid, sealhulgas USA, kaitsevad nahkhiiri kui ohustatud liike ega luba neid eemaldamisprotsessi ajal hävitada. Majaomanikud võivad soovida ühendust võtta professionaalse hävitajaga, kes suudab nakkuse täielikult eemaldada ilma loomi tapmata. Loomade tagasipöördumise vältimiseks peaksid nad kohe pärast selle lõpetamist sulgema kõik allesjäänud avad maja pööningul või sarikates. Mõned neist teenustest nõuavad tasu ka loomade jäätmete äraveo eest.
Nahkhiire guaano on mürgine ainult siis, kui seda häiritakse, ja hajub ise kahjutult õhku, kui seda kahe kuni kolme aasta pärast puutumata jätta. Kui nakatumine leidis aset majaosas, mida saab elanike eest isoleerida, või harva kasutatavas kõrvalhoones, võib olla kasulik väljaheidet üldse mitte eemaldada. Enamik haigusjuhtumeid seda tüüpi jäätmetega kokkupuutest ilmneb pärast pesa või pesa lähedal asuva pinnase puhastamist ja eemaldamist. Kui majaomanik eelistab ala puhastada, peaks ta kandma näomaski, mis suudab filtreerida kuni ühe millimikroni suuruseid osakesi. Ta peaks jäätmete eemaldamiseks kasutama ülitõhusa õhufiltriga vaakumit ja visata need kohe suletud prügikotti.