Austraalias on endeemilisi liike tuhandeid (ei leidu kusagil mujal). Seda võib seostada mandri geograafilise isoleeritusega – see on mandritest kõige isoleeritum ja mittepõliselanikud avastasid selle alles 1606. aastal. Kuni Suessi kanali ehitamiseni oli Austraalia ainus kontinent, mida ei ühendanud maad teistele kontinentidele. Austraalia on olnud teistest kontinentidest isoleeritud pärast seda, kui ta eraldus Antarktikast umbes 40 miljonit aastat tagasi.
Kõige kuulsamad Austraalia endeemilised liigid on langesloomad. Marsupiaalid on imetajad, kellel on platsentaimetajatest erinev põlvnemine ja anatoomilised erinevused, sealhulgas madalam kehatemperatuur, varajane sünd, platsenta puudumine ja erinevad suguelundid. Nende hulka kuuluvad taimtoidulised, nagu koaala, vombat, rotikängur, wallaby ja kuulus känguru, omnivoor bandicoot, Sugar Glider, marsupial mutt ja erinevad wallabies, lihasööja quoll, kowari, numbat, mulgara, antechinus ja paljud teised. Kokku on Austraalias endeemilised 224 kukkurloomaliiki. Marsupiaalid on Austraalias platsentad täielikult välja tõrjunud.
Teised Austraaliale endeemilised liigid on monotreemid, oma kategooria ebatavalised imetajad. Nende ainevahetus on isegi aeglasem kui kukkurloomadel, kuigi neil on kõik imetajate standardsed tunnused, nagu karv ja võime poegi lüpsta. Monotreemide hulka kuuluvad neli ehnidnaliiki ja kallaklind, keda peetakse loomariigi üheks ebatavalisemaks liikmeks. Platypust kirjeldatakse kui pardnokk-, koprasaba- ja saarmasjalg-. Tema tagajalal on mürgine kannus ja ta muneb mune, üks ainsaid imetajaid, kes seda teeb. Monotreeme oli aastaid halvasti mõistetud, neid peeti “primitiivsemateks” imetajateks. Nad eraldusid evolutsiooniliselt teistest imetajatest umbes 150 miljonit aastat tagasi, dinosauruste ajastul.
Austraalias on palju teisi endeemilisi liike, kuigi kõige kuulsamad on kukkurloomad ja monotreemid. Austraalias on umbes 83% imetajatest endeemilised, 89% roomajatest, 90% kaladest ja putukatest ning 93% kahepaiksetest. Sinna leiab oma kodu kuulus emu, jaanalinnuga sugulane lennuvõimetu lind, keda leidub Austraalia vapil. Mandril on palju endeemilisi papagoiliike. Kõigist elavatest krokodilliliikidest suurim soolaveekrokodill on levinud Põhja-Austraalias, kuid teda võib kohata ka Kagu-Aasias. Mageveekrokodill, palju väiksem liik, on Põhja-Austraalias endeemiline.