Ettevõtte auditiosakonnas töötab sertifitseeritud siseaudiitor. Siseaudiitor on mures sisemiste toimingute pärast, välisaudiitor aga teise ettevõtte finantstoimingute pärast. Isik saab sertifitseeritud siseaudiitoriks (CIA), sooritades eksami, mille sponsoriks on Siseaudiitorite Instituut. Sertifikaadi saamine annab professionaalsuse ja usaldusväärsuse valdkonnas, mis on enamikus kohtades suures osas reguleerimata.
Siseauditi funktsioon on raamatupidamisosakonnast eraldiseisev, tagades audiitoritele oma ülesannete täitmisel sõltumatuse. Igasuguse auditi põhimõte on, et inimene ei saa ise oma tööd auditeerida ning sellest eeldusest lähtuvalt ei täida siseaudiitorid mingeid raamatupidamis- ega juhtimisfunktsioone. Nad vaatavad läbi olemasolevad finants- ja juhtimistoimingud, otsides sisekontrolli nõrkusi, protsesside tõhususe või tõhususe probleeme ning probleeme finantsteabe usaldusväärsusega.
Sertifitseeritud siseaudiitor järgib auditiprogrammi, et veenduda, et ta katab auditi kõik olulisemad aspektid. Auditiprogramm on loetelu üksustest ja mõnikord ka küsimustest, mis tuleb auditi eesmärgi saavutamiseks üle vaadata ja neile vastata. Sageli loovad auditijuhid auditiprogramme või vaatavad need läbi, et veenduda, et inimesed jätkavad oma ülesannet. Auditijuhtidel on tavaliselt sellised volitused nagu CIA või Certified Public Accountants (CPA).
Töötajate küsitlemine on osa sertifitseeritud siseaudiitori tööst koos tehingute ülevaatamisega, et veenduda protsesside ja protseduuride järgimises. Näiteks otsib siseaudiitor makstud arveid üle vaadates allkirju, et veenduda ostu nõuetekohases volitamises. Siseauditi töö võib hõlmata pettuste või ebatavalise olukorra uurimist. Selle ulatus võib olla väga lai.
Auditimeeskond võib avaldada aruandeid, milles kommenteeritakse leide ja antakse juhtkonnale soovitusi. Aruanded on konfidentsiaalsed, kirjeldades üksikasjalikult kõiki tekkinud probleeme, nende mõju ja soovitusi probleemide lahendamiseks. Pärast seda, kui auditirühm esitab aruandes leiud, peab juhtkond järgmiseks sammuks aruannetele alla kirjutama, nõustudes leidude ja soovitustega või mitte.
Siseaudiitoreid leidub suurkorporatsioonides ja nad on juhtimise lahutamatu osa. Nende töö on laiaulatuslik ja töö võib olla väga huvitav. Reisimine on tavaliselt osa siseaudiitori elust ja sageli toimub reisimine väljaspool USA-d. Paljud siseaudiitorid otsustavad oma usaldusväärsuse ja professionaalsuse parandamiseks saada sertifitseeritud siseaudiitori volikirja.