Fondi raamatupidaja ametikoht on traditsiooniliselt mittetulundusühingus või valitsusharus, mille eesmärk on tagada eelarveline vastutus. Selles rollis jagab isik sissetuleku kategooriatesse ehk fondidesse, et teha kindlaks nii vahendite allikas kui ka kuidas seda kasutatakse. Sellest tulenevalt vastutab fondi raamatupidaja heade majandamise tavade demonstreerimise, organisatsiooni finantsseisundi kindlaksmääramise, planeerimise ja eelarvestamise, rahavoogude jälgimise ning peamiste huvirühmadega suhtlemise eest.
Fondiarvestuses on eesmärgiks finantstehingute kategooriline jaotamine üld- ja piiratud fondide vahel, sest igal fondil on kindel ja volitatud eesmärk. Üldfond katab tegevuskulud, nagu töötajate palgad, kontoritarbed ja hoolduskulud; seevastu erifondid on piiratud tagamaks, et neid kasutatakse ainult selliste tegevuste rahastamiseks, mille rahastaja või rahastaja on konkreetselt heaks kiidetud kuludena ette näinud. Sisuliselt võimaldab fondiarvestus organisatsioonidel jälgida kulutusi, et tagada piiratud vahendite õige eraldamine. Kuigi ettevõtte jaoks on oluline oma raha õigesti eraldada, on see oluline ka nende inimeste jaoks, kes organisatsioonile raha eraldavad. Inimesed, kes annavad raha heategevusele, ettevõttele või muule organisatsioonile, tahavad teada, et organisatsioon kasutab raha tõhusalt.
Fondi raamatupidaja vastutab aruandekohustuse ja juhtimise eest, hinnates, kas organisatsioon kasutas vahendeid nõuetekohaselt ja dokumenteeris selle õigesti. Fondi raamatupidaja määrab ka ettevõtte finantsseisundi, tuvastades olemasolevad ressursid, nende väärtuse ja mis tahes finantsmõju, mida organisatsioon võib kogeda, kui need asendatakse või eemaldatakse. Fondiraamatupidajad grupeerivad varad ja kohustused vastavalt sihtotstarbele, milleks neid kasutada, et tagada piiratud ja piiranguteta vahendite lahushoidmine.
Traditsioonilised kasumile orienteeritud ettevõtted keskenduvad kasumlikkusele ja neil on üks pearaamat. Seevastu peavad fondiraamatupidajad rohkem kui ühte pearaamatut, olenevalt annetajatest ja kulutustest. Näiteks võib olla üldkonto, mida kasutatakse piiramatute vahendite jaoks, ja ehitusfondi konto, mida kasutatakse ehituseks saadaoleva raha jälgimiseks.
Eelarve koostamine on samuti oluline vastutus, sest fondiraamatupidajad peavad määrama, kuidas raha jaotatakse ja milliseid ressursse konkreetse projekti jaoks vaja on. Lisaks vastutab fondi raamatupidaja organisatsiooni eelarvetulemuste hindamise eest, võrreldes kavandatud eesmärkidega, et tagada tegevuse tõhusus. Sellel ametikohal hinnatakse fondi tegevust, et jälgida kulutusi ja planeerida ettenägematuid sündmusi. Lõpuks edastab tõhus fondiraamatupidaja lühidalt otsustajatele olulist finantsteavet selgelt ja usaldusväärselt.