Veterinaar-ultraheli kasutatakse paljudel samadel juhtudel, mis nõuavad ultraheli kasutamist inimestel. See võib olla kasulik diagnostikavahend ja seda saab kasutada ka käimasolevate tingimuste jälgimiseks. Mõnel juhul võib osutuda vajalikuks kasutada veterinaar-ultraheli, sest loomad ei saa inimestega oma sümptomite osas suhelda ja seetõttu võidakse ulatusliku patsiendiintervjuu asemel kasutada ultraheli.
Üks levinumaid põhjuseid, miks veterinaararst kasutab ultraheli, on abivahend diagnoosimisel. Näiteks kui isase kassi toob omanik, kes väidab, et kassil on urineerimisraskusi, võib veterinaararst kasutada ultraheli, et kontrollida põie või kusiti ummistust. Ultraheli saab kasutada ka kahtlaste masside ja muude käsitsi läbivaatuse käigus ilmnevate leidude uurimiseks. Seda saab kasutada ka hädaolukorras tõsiste meditsiiniliste probleemide, näiteks kokkupõrke tagajärjel kahjustatud siseorganite otsimiseks.
Kliinik võib käimasoleva seisundi jälgimiseks kasutada ka veterinaar-ultraheli. Rasedale koerale võidakse teha näiteks mitmeid ultraheliuuringuid, et kinnitada tiinust ja hinnata arenevate kutsikate tervist. Ultraheli saab kasutada ka maksa- ja neeruhaiguste progresseerumise jälgimiseks koos kõigi ravimeetoditega, täpselt nagu inimestel.
Suurloomade veterinaar-ultraheli saab kasutada näiteks võidusõiduhobuse südame tervise kontrollimiseks, lehma aretamiseks valmisoleku kindlakstegemiseks või kitse soolesulguse allika kontrollimiseks. Veterinaar-ultraheli saab kasutada ka selliste protseduuride nagu biopsiate juhtimiseks, kusjuures loomaarst uurib huvipakkuvat piirkonda ultraheliga, et kinnitada, et proov on võetud õigest kohast.
Suurte loomade puhul võib veterinaar ultraheliaparaadi looma juurde tuua, et vähendada looma stressi enne uuringut. Väikeloomad tuleb üldjuhul tuua veterinaarkliinikusse ultraheliuuringule. Mõlemal juhul on protseduur valutu ja loom ei vaja üldjuhul rahustamist, kuigi tavaliselt on kohal veterinaartehnik või assistent, kes hoiab ja rahustab looma, et loomaarst saaks hea pildi. Veterinaar-ultraheli võib olenevalt uuringu põhjusest ja looma tüübist võtta aega 30 minutist kuni pooleteise tunnini.
Mitte kõik loomaarstid ei paku ultraheli. Mõnel loomaarstil võib olla vaja suunata kliendid teise veterinaararsti või veterinaar-ultraheli spetsialisti juurde. Omanikud võivad mõnel juhul otsustada läbivaatuse ajal kohal olla ja veterinaararst võib anda teavet ultraheliuuringu käigus nähtud anatoomiliste struktuuride kohta. Sõltuvalt pildiuuringu tulemustest võib veterinaar soovitada parimat tegutsemisviisi, mis võib varieeruda alates täiendava testimise nõudmisest kuni ravimi vahetamise soovitamiseni kuni looma hoolduse jätkamiseni nagu varem.