Mikroskoop on teadlane, kes uurib mikroskoobi abil mitmesuguste materjalide struktuure ja koostist. Tavaliselt valmistab ta oma proovid ette, vaatab neid mikroskoobi all, paneb tähele oma taju ja salvestab või pildistab mikroskoopilisi pilte. Amatöörmikroskoop võib kasutada lihtsat valgusmikroskoobi suuremate isendite uurimiseks, alates sibulakoortest kuni juuksefolliikuliteni. Kuna mikroskoop edeneb oma töös, võib ta kasutada keerukamaid instrumente, nagu kontrastvalgusmikroskoope ning skaneerivaid elektron- ja tunnelelektronmikroskoope. Tunnelelektronmikroskoobid võimaldavad kõige arenenumatel mikroskoobidel uurida üksikuid aatomeid ja molekule.
Mikroskoopiat kasutatakse peaaegu kõigis teadusuuringute valdkonnas. Näiteks töötavad paljud mikroskoobid tsütoloogia või anatoomia alal. Nad võivad mikroskoobi all otsida vähirakke, vere kaudu levivaid patogeene, baktereid või viirusi. Mõned mikroskoobid võivad otsida ainult konkreetseid materjale, näiteks vähirakke. Kui rakud on olemas, teavitatakse tulemustest arsti ja patsienti ning mikroskoobi töö lõpeb sellega. Teised mikroskoobid võivad töötada selle nimel, et uurida viise, kuidas vähirakud levivad, kuidas viirused muteeruvad ja mis tapab teatud tüüpi baktereid.
Mitte kõik mikroskoobid ei uuri inimkehaga seotud materjale. Mõned uurivad taime- ja loomaelu. Näiteks võivad nad uurida veeproove, et näha, millised bakterid või toksiinid vees on.
Mikroskoobiarst ei pea aga elusorganisme uurima. Näiteks kasutavad geoteadlased transmissioonelektronmikroskoope geoloogiliste materjalide uurimiseks nanomeetri skaalal. Selle tulemusena saavad nad rohkem teada erinevate geoloogiliste moodustiste keemilise koostise, oksüdatsiooni ja ilmastikumõjude kohta.
Olenevalt sellest, milline õppesuund mikroskoopi huvitab, on karjäärivõimalusi lugematu arv. Spetsialistid võivad leida võimalusi töötada meditsiini, bioloogia ja geoloogia valdkonnas. Võimalusi on ka kohtuekspertiisi, elektroonika ja toiduteaduse valdkonnas. Üldiselt palgatakse mikroskoope ülikoolidesse, haiglatesse ja meditsiinikoolidesse. Samuti võivad nad otsida tööd muuseumides, valitsusasutustes, sõltumatutes laborites ja suurkorporatsioonides.
Inimesele, kes soovib saada mikroskoobiks, on parim, kui ta läbib keskkoolis nelja-aastased loodusteaduste kursused. Soovitatav on omandada nelja-aastane kraad bioloogias, keemias, geoloogias või füüsikas, eriti neile, kes soovivad töötada keerulisemas, teaduspõhises keskkonnas. Mikroskoopia alal on palju kaheaastaseid kursusi, mis õpetavad põhitõdesid. Kaheaastased programmid sobivad ideaalselt inimestele, kes soovivad karjääri teha mikroskoopilise tehnikuna.