Loomaterapeudi tööülesanded võivad olla üsna erinevad, olenevalt sellest, millist tööd terapeut otsustab teha ja millistest erialadest ta võib töötada. Keegi, kes töötab loomadega käitumisterapeudina, aitab sageli loomi, tavaliselt kodustatud või meelelahutuseks mõeldud loomi, treenida teatud viisil käituma. Samuti on kohustusi loomaterapeudil, kes aitab loomi füsioteraapias, sageli abistades loomi sarnaselt sellega, kuidas füsioterapeut inimesi aitab. Mõned terapeudid, kes keskenduvad inimestega töötamisele, saavad kasutada loomade abistavat ravi, kasutades loomi, et aidata inimestel ületada mitmesuguseid raskusi või tingimusi.
Loomaterapeut on tavaliselt keegi, kes töötab loomadega professionaalselt teatud tüüpi terapeutilistel eesmärkidel, kuigi selle töö täpne olemus võib üsna palju erineda. Loomade käitumisterapeudid töötavad sageli erinevat tüüpi loomadega, et mõista, miks see teatud viisil käitub, ja seejärel aidata negatiivset käitumist muuta või parandada. See töö hõlmab sageli terapeudipoolset vaatlust, et mõista, kuidas loom käitub, ja tõlgendada seda tegevust eelnevate teadmiste põhjal loomade käitumisest. Käitumisprobleemidega tegelev loomaterapeut aitab tavaliselt omanikul seda looma koolitada, et ta käituks sobivamal või vastuvõetavamal viisil.
Samuti on mõned füsioteraapia vormid, mida saab teha loomaterapeut. Seda tüüpi tööd tehakse sageli pärast seda, kui loom on saanud vigastuse või läbinud operatsiooni, sarnaselt inimeste füsioterapeudide tööga. Seda tüüpi loomaterapeut saab seejärel aidata loomal uuesti kõndima või jooksma õppida või kohaneda vigastustega, mis võisid oluliselt mõjutada looma mugavat liikuvust. Seda tüüpi töö hõlmab sageli loomade käitumise jälgimist ja mõistmist, kuidas loom võib reageerida füüsilistele muutustele, mida ta on läbi teinud.
Mõned terapeudid, kes töötavad inimestega, saavad kasutada loomade abistavat ravi. See teraapia järgib tavaliselt teatud rutiine ja teraapiastrateegiaid, kasutades loomi. Inimene, kellel on raskusi depressiooniga toimetulekul, võib näiteks kogeda üksinduse ja eraldatuse tunnet puude või muu seisundi tõttu. Lemmiklooma tutvustamine inimese ellu võib mõnel juhul aidata neid tundeid leevendada. Terapeut teeb tavaliselt koostööd loomatreeneriga, et valida õige loom, kes teraapias inimest abistaks.