Bakterite tuvastamine on protsess, mida kasutatakse konkreetsete bakterite identiteedi kindlakstegemiseks. See on meditsiinilise ravi oluline osa, kuna paljud ravimeetodid sõltuvad suuresti konkreetse meditsiinilist probleemi põhjustava organismi identiteedist, ja see on ka teadusuuringute oluline osa. Bakterite tuvastamisel kasutatakse mitmeid tehnikaid ja uusi tehnikaid töötatakse pidevalt välja, kuna inimesed saavad bakterite kohta rohkem teada ja töötatakse välja uusi meditsiiniseadmeid.
Bakterite tuvastamise esimene etapp hõlmab isolaadi loomist, kõnealuste bakterite tööproovi. Isolaadid algavad patsiendilt või objektilt võetud väikese kahtlustatava bakteri tampooniga. Isolaadi loomiseks leitakse kasvukeskkond, mis toetab baktereid, ja kultiveeritakse piisavalt baktereid uurimiseks. See võib olla tõeline väljakutse, kuna bakterid on väga valivad ja nad ei kasva üheski keskkonnas. Samuti on oluline vältida kasvusöötme või proovi saastumist, kuna see võib põhjustada segaseid tulemusi.
Kui bakter on kultiveeritud, saab selle identiteedi kohta vihjete andmiseks kasutada mitmesuguseid tööriistu. Üks kõige elementaarsem on Grami plekk, mis jagab bakterid grampositiivseteks ja gramnegatiivseteks bakteriteks keemilise peitsi abil. Kontrastsuse suurendamiseks saab kasutada muid plekke, mis muudavad bakterid mikroskoobi all paremini nähtavaks. Visuaalset identifitseerimist mikroskoobi all saab tavaliselt teha tuttavate bakteriliikidega, eriti nendega, millel on eriline kuju.
Bakterite tuvastamise arsenalis on rohkem tööriistu. Teadlane võib kasutada seroloogilisi meetodeid, mis hõlmavad tundmatute bakterite proovi eksponeerimist erinevatele antikehadele, et näha, kas reaktsioon on toimunud, või geenide järjestamist, mille käigus lahti harutatakse bakteri geneetiline kood. Geenide järjestamist saab kasutada ka kahe tihedalt seotud bakteritüve eristamiseks, pakkudes teavet selle kohta, miks üks tüvi reageerib teatud ravikuurile, teine aga mitte. Samuti võib uurida reaktsioone erinevatele kemikaalidele ja stiimulitele nagu ultraviolettkiirgus.
Bakterite tuvastamine toimub klassikaliselt laboris, kuna laborites on meditsiiniseadmed, kemikaalid ja tööriistad, mida saab kasutada bakteri identiteedi tuvastamiseks. Mõned laborid on spetsialiseerunud haiglate ja meditsiinikliinikute proovide kultiveerimisele ja tuvastamisele, samas kui teised keskenduvad uurimistööle, tuvastades uute ja tundmatute bakterite proove, et neid saaks klassifitseerida. Laborikeskkonda kontrollitakse rangelt, et vältida laboritöötajate saastumist ja juhuslikku nakatumist. Eriti virulentseid organisme uuritakse kõrge turvalisusega laborites, mis hõlmavad teadlastele mitut kaitsekihti.