Väikeettevõtte jaoks parima viirusetõrjetarkvara leidmine võib aidata tugevdada digitaalset turvalisust, mis võib olla kasulik häkkerite tõrjumisel, mida meelitavad suured rünnakud, mis põhjustavad märgatavat kahju. Paljud väikeettevõtted kasutavad vähemalt mõnda arvutit, seega võib tarkvaraga saadaolevate litsentside arv olla oluline. Tsentraliseeritud käsk võimaldab ühel arvutil konfigureerida kõigi teiste arvutite turvalisust; ilma selleta võib üks või mitu arvutit olla ohus ja turvalisust võib olla raske täielikult kontrollida. Paljud häkkerid on hõivatud uute viiruste loomisega, seega peaks väikeettevõtte parimal viirusetõrjetarkvaral olema järjepidev viirusedefinitsiooni uuendus. Viirusetõrjeprogrammid mõjutavad arvuti erinevaid aspekte ja paljusid aspekte kaitsva programmi hankimine on tavaliselt parem.
Enamik viirusetõrjeprogramme on varustatud piiratud arvu litsentsidega, mis tähendab, et neid saab installida piiratud arvule arvutitele; see tagab arendajale piisava tasustamise. Üks litsents sobib tavaliselt ainult ühe arvuti jaoks, seega vajab väikeettevõte tavaliselt iga arvuti jaoks litsentsi. Väikeettevõtte omanik peaks otsima viirusetõrjetarkvara arendaja, kes müüb tema vajaduste rahuldamiseks piisavalt litsentse; vastasel juhul võib mõni arvuti ilma turvalisuseta olla.
Kui võrku lisatakse väikeettevõttele mõeldud viirusetõrjetarkvara, on tavaliselt kõige parem, kui ühte arvutit saab tähistada tsentraliseeritud käsuna. See võimaldab ühel arvutil samaaegselt kontrollida kõigi teiste arvutite turvalisust. Ilma selleta tuleb iga arvuti eraldi seadistada, mis võtab aega ja riskib ühe või mitme arvuti valesti seadistamisega.
Häkkerid leiavad sageli uusi viise võrkudesse hiilimiseks, luues uusi viiruseid või täiustades vanu. Väikeettevõttel on suurem ründeoht kui üksikul kasutajal, seega peaks viirusetõrjetarkvara uute rünnakute vastu võitlemiseks olema värskendatud viiruse definitsioonid. Automaatsed värskendused pole vajalikud, kuid tavaliselt muudavad need tarkvaral rünnakute peatamise lihtsamaks, kuna see teab uusimatest viirustest.
Väikeettevõttele mõeldud viirusetõrjetarkvara on loodud arvuti erinevate aspektide ja tüüpiliste kasutatavate rakenduste turvamiseks. Näiteks kontrollib meilikaitse e-kirju ohtude suhtes, skripti blokeerimine aga peatab veebisaidilt tuleva pahaloomulise skripti. Väikeettevõtte omanik peaks kontrollima, milliseid aspekte programm kaitseb, ja tagama, et see pakub igakülgset kaitset mõne või iga väikeettevõtte kasutatava rakenduse jaoks. Vastasel juhul võib viirus sisse hiilida kaitsmata rakenduse kaudu.